RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W OPY2Q06810 360 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W SYO1Q07395 620 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W GRC3Q07845 632 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W HAT1Q12341 374 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ILS1P09436 1072 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ITR2P30606 609 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W RIB7P33312 244 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YKL063CP35725 167 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W VPS51P36116 164 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W HAM1P47119 197 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ALT1P52893 592 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W SFB2P53953 876 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ADE13Q05911 482 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W PEP7P32609 515 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W NPL6P32832 435 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W CTK3P46963 296 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ALB1P47019 175 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ATH1P48016 1211 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W DON1Q05610 365 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W GPR1Q12361 961 aa5.51□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W REP1P03871 373 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W CDC16P09798 840 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W DSF1P0CX08 502 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YNR073CP0CX09 502 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W HCA4P20448 770 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W VPS1P21576 704 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W JNM1P36224 373 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W FZO1P38297 855 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W RGD1P38339 666 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YHL012WP38709 493 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ATG32P40458 529 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YIL092WP40497 633 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ILM1P47155 203 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W SEC5P89102 971 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YOR296WQ08748 1289 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W AUS1Q08409 1394 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ACE2P21192 770 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YJU2P28320 278 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W APE4P38821 490 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W GTT3P39996 337 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W VTC4P47075 721 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W FYV6P53913 173 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W MFM1Q02783 413 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TAF11Q04226 346 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W DYN3Q04949 312 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W SVF1Q05515 481 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W DPL1Q05567 589 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ATG17Q06410 417 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TFC8Q12308 588 aa5.5□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W PGK1P00560 416 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W GCD2P12754 651 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W MBP1P39678 833 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W GEM1P39722 662 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W RVS167P39743 482 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ACF4P47129 309 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W MDR1P53258 950 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YOL036WQ08206 761 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YPL191CQ08930 360 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W RRP6Q12149 733 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W MSB4Q12317 492 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TY2B-FP0CX63 1770 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TY2B-CP25384 1770 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TY2B-DR2Q03494 1770 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TY1B-DR1Q03855 1755 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TY2B-OR1Q12113 1770 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TY2B-DR1Q12472 1770 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TY2B-OR2Q12501 1770 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W SRS2P12954 1174 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TYR1P20049 452 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W MCM3P24279 971 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W DPB3P27344 201 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ATO2P32907 282 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W SEG2P34250 1132 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W AMN1P38285 549 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W RIM11P38615 370 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YJL070CP40361 888 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W SAP155P43612 1002 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YGR153WP48238 217 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W RNR4P49723 345 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W MIG2P53035 382 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YGR016WP53209 190 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W VPS36Q06696 566 aa5.49□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W FOB1O13329 566 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W RPP0P05317 312 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TAL1P15019 335 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W DAL80P26343 269 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YKR018CP36114 725 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ATP3P38077 311 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W BAP2P38084 609 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W LIN1P38852 340 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W MTW1P39731 289 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W CIR1P42940 261 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W VPS53P47061 822 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TRF5P48561 642 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 93.5 ms