RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNQ4	P56696	695 aa		11.72	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIF16B	Q96L93	1317 aa		11.72	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	G2E3	Q7L622	706 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	STARD3NL	O95772	234 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	ITPK1	Q13572	414 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDIA6	Q15084	440 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	A1BG	P04217	495 aa		11.71	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYL6B	P14649	208 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	11.7	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	NBPF14	Q5TI25	921 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	NBPF15	Q8N660	670 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNN	Q9UQP3	1299 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM27	P14373	513 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	FLII	Q13045	1269 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	APBA3	O96018	575 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	HYPK	Q9NX55	129 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	TJP1	Q07157	1748 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERBB4	Q15303	1308 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	CACNA1F	O60840	1977 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	RLBP1	P12271	317 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	PANK1	Q8TE04	598 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTPRC	P08575	1304 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	NEFL	P07196	543 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	LY75	O60449	1722 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLSCR1	O15162	318 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	PROM2	Q8N271	834 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576		F6X3S4	739 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDE3A	Q14432	1141 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	COPS6	Q7L5N1	327 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	TXNRD1	Q16881	649 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	FKBP8	Q14318	412 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABCC4	O15439	1325 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	COG6	Q9Y2V7	657 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	MS4A1	P11836	297 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADCY9	O60503	1353 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	CRBN	Q96SW2	442 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARX	Q96QS3	562 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	GNPAT	O15228	680 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMIM5	Q71RC9	77 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EFTUD2-223	ENST00000592576	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 140.4 ms