RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571855.1

ABCC3-218, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, humanhuman

Gene ABCC3, Length 1,562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3-218ENST00000571855 GNAI1P63096 354 aa21.65■■□□□ 1.06
ABCC3-218ENST00000571855 SMIM5Q71RC9 77 aa21.65■■□□□ 1.06
ABCC3-218ENST00000571855 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.65■■□□□ 1.06
ABCC3-218ENST00000571855 USP16Q9Y5T5 823 aa21.65■■□□□ 1.06
ABCC3-218ENST00000571855 RPS6KA4O75676 772 aa21.64■■□□□ 1.05
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ABCC3-218ENST00000571855 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
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ABCC3-218ENST00000571855 MBIPQ9NS73 344 aa21.64■■□□□ 1.05
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ABCC3-218ENST00000571855 MSH5O43196 834 aa21.6■■□□□ 1.05
ABCC3-218ENST00000571855 A1BGP04217 495 aa21.6■■□□□ 1.05
ABCC3-218ENST00000571855 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.6■■□□□ 1.05
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ABCC3-218ENST00000571855 ZNF521Q96K83 1311 aa21.59■■□□□ 1.05
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ABCC3-218ENST00000571855 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
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ABCC3-218ENST00000571855 COL15A1P39059 1388 aa21.54■■□□□ 1.04
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ABCC3-218ENST00000571855 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ABCC3-218ENST00000571855 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.52■■□□□ 1.04
ABCC3-218ENST00000571855 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.52■■□□□ 1.03
ABCC3-218ENST00000571855 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.51■■□□□ 1.03
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ABCC3-218ENST00000571855 E9PSI1 815 aa21.46■■□□□ 1.03
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ABCC3-218ENST00000571855 SCN7AQ01118 1682 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCC3-218ENST00000571855 BCORQ6W2J9 1755 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCC3-218ENST00000571855 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.41■■□□□ 1.02
ABCC3-218ENST00000571855 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.41■■□□□ 1.02
ABCC3-218ENST00000571855 VAMP4O75379 141 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCC3-218ENST00000571855 MMP10P09238 476 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCC3-218ENST00000571855 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ABCC3-218ENST00000571855 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ABCC3-218ENST00000571855 TM4SF1P30408 202 aa21.39■■□□□ 1.01
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