RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 RPS6KA4O75676 772 aa22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 STARD3NLO95772 234 aa22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 A1BGP04217 495 aa22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 MBIPQ9NS73 344 aa22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 SSFA2P28290 1259 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 IFT57Q9NWB7 429 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 GNAI1P63096 354 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 MSL1Q68DK7 614 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 MTFR1LQ9H019 292 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPON1Q9HCB6 807 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 NBPF26B4DH59 902 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 WDR63Q8IWG1 891 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 NBPF15Q8N660 670 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 NECTIN2Q92692 538 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 RFC4P35249 363 aa22.7■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF521Q96K83 1311 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADRA2BP18089 450 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 PTGER2P43116 358 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 IL16Q14005 1332 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 NGEFQ8N5V2 710 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 COL15A1P39059 1388 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 TSPYL6Q8N831 410 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 GYS1P13807 737 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARXQ96QS3 562 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 C4AP0C0L4 1744 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANXA1P04083 346 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYL6BP14649 208 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 PDIA6Q15084 440 aa22.64■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 PROSER3Q2NL68 480 aa22.64■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZPR1O75312 459 aa22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 FKBP8Q14318 412 aa22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 NARFQ9UHQ1 456 aa22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.62■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.61■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.61■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 LRP5O75197 1615 aa22.61■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 A0A087WZG4 1122 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 HOXB7P09629 217 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 POLD1P28340 1107 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 GOLGA2Q08379 1002 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 CAMTA2O94983 1202 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 MMP10P09238 476 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.58■■□□□ 1.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.58■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 ERBB4Q15303 1308 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLFN5Q08AF3 891 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 TM4SF1P30408 202 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 DDR1Q08345 913 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 NFIXQ14938 502 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 HLFQ16534 295 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 E9PSI1 815 aa22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms