RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535353.3

CSAG2-201, Transcript of CSAG family member 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CSAG2, Length 237 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2-201ENST00000535353 LTBP3Q9NS15 1303 aa12.88□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 IP6K1Q92551 441 aa12.87□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 EPHX2P34913 555 aa12.86□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 HACL1Q9UJ83 578 aa12.86□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 HPS5Q9UPZ3 1129 aa12.86□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa12.86□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 FKBP8Q14318 412 aa12.85□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 CIAPIN1Q6FI81 312 aa12.85□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 MAP3K19Q56UN5 1328 aa12.85□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa12.85□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 CACNA1SQ13698 1873 aa12.85□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CSAG2-201ENST00000535353 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP12.83□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 CST9Q5W186 159 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 DCAF11Q8TEB1 546 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 TAOK3Q9H2K8 898 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 BCORQ6W2J9 1755 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 CYP27B1O15528 508 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 RPS6KA4O75676 772 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 HHIPL1Q96JK4 782 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 STAC3Q96MF2 364 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 SAGE1Q9NXZ1 904 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 SAPCD2Q86UD0 394 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 NME9Q86XW9 330 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 ASAP1Q9ULH1 1129 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 AKAP11Q9UKA4 1901 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 RNF123Q5XPI4 1314 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 ZNF541Q9H0D2 1346 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 TM4SF1P30408 202 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP12.79□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 CARMIL3Q8ND23 1372 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 C21orf2O43822 256 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 TATP17735 454 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 C2CD5Q86YS7 1000 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG2-201ENST00000535353 TRAF5O00463 557 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 HOXC9P31274 260 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 NOGQ13253 232 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 NBPF6Q5VWK0 638 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 USHBP1Q8N6Y0 703 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 NBPF4Q96M43 638 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 SLC4A9Q96Q91 983 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 TMOD3Q9NYL9 352 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 TJP1Q07157 1748 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 SLX4Q8IY92 1834 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 H0YIN7 160 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 ZIC5Q96T25 663 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 ATG3Q9NT62 314 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 UNC80Q8N2C7 3258 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 RTL1A6NKG5 1358 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 AKAP4Q5JQC9 854 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 EVC2Q86UK5 1308 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 MPNDQ8N594 471 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 BRCA2P51587 3418 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
CSAG2-201ENST00000535353 CELF2O95319 508 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 NFIXQ14938 502 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 SOGA3Q5TF21 947 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 GPC2Q8N158 579 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 RNF186Q9NXI6 227 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 CEP290O15078 2479 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 TRPA1O75762 1119 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 AMPHP49418 695 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP12.69□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 OTUD5Q96G74 571 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 HTTP42858 3142 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 SERPINB2P05120 415 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 CRKLP46109 303 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 BICDL1Q6ZP65 573 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 LAMB4A4D0S4 1761 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 VCANP13611 3396 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 FZD9O00144 591 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 USPL1Q5W0Q7 1092 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 NCAPD2Q15021 1401 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 POTEFA5A3E0 1075 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
CSAG2-201ENST00000535353 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.3 ms