RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533872.5

RPS2-215, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 5

Gene RPS2, Length 1,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-215	ENST00000533872	GNPAT	O15228	680 aa		31.96	■■■□□ 2.71
RPS2-215	ENST00000533872	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
RPS2-215	ENST00000533872	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		31.95	■■■□□ 2.71
RPS2-215	ENST00000533872	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		31.94	■■■□□ 2.7
RPS2-215	ENST00000533872	SSFA2	P28290	1259 aa		31.94	■■■□□ 2.7
RPS2-215	ENST00000533872	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
RPS2-215	ENST00000533872	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		31.94	■■■□□ 2.7
RPS2-215	ENST00000533872	RPS6KA4	O75676	772 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RPS2-215	ENST00000533872	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RPS2-215	ENST00000533872	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
RPS2-215	ENST00000533872	USP16	Q9Y5T5	823 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RPS2-215	ENST00000533872	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RPS2-215	ENST00000533872	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
RPS2-215	ENST00000533872	ADRA2B	P18089	450 aa		31.89	■■■□□ 2.7
RPS2-215	ENST00000533872	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
RPS2-215	ENST00000533872	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
RPS2-215	ENST00000533872	C4A	P0C0L4	1744 aa		31.88	■■■□□ 2.69
RPS2-215	ENST00000533872	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
RPS2-215	ENST00000533872	PHF14	O94880	888 aa		31.87	■■■□□ 2.69
RPS2-215	ENST00000533872	HOXB7	P09629	217 aa		31.86	■■■□□ 2.69
RPS2-215	ENST00000533872	KRT24	Q2M2I5	525 aa		31.86	■■■□□ 2.69
RPS2-215	ENST00000533872	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
RPS2-215	ENST00000533872	A1BG	P04217	495 aa		31.85	■■■□□ 2.69
RPS2-215	ENST00000533872	SMIM5	Q71RC9	77 aa		31.85	■■■□□ 2.69
RPS2-215	ENST00000533872	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RPS2-215	ENST00000533872	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
RPS2-215	ENST00000533872	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RPS2-215	ENST00000533872	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RPS2-215	ENST00000533872	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
RPS2-215	ENST00000533872	COL15A1	P39059	1388 aa		31.82	■■■□□ 2.69
RPS2-215	ENST00000533872	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872	GOLGA2	Q08379	1002 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872	ERBB4	Q15303	1308 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872	MSH5	O43196	834 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	31.81	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872	MTFR1L	Q9H019	292 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872	NBPF26	B4DH59	902 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872	NBPF15	Q8N660	670 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872		E9PSI1	815 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872	ZBTB7A	O95365	584 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872	RFC4	P35249	363 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RPS2-215	ENST00000533872	LRP5	O75197	1615 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872		A0A087WZG4	1122 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	SLFN5	Q08AF3	891 aa		31.74	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	TSPYL6	Q8N831	410 aa		31.74	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	SCN7A	Q01118	1682 aa		31.73	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	SPON1	Q9HCB6	807 aa		31.73	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		31.72	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		31.72	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	PDIA6	Q15084	440 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	NECTIN2	Q92692	538 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	NARF	Q9UHQ1	456 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		31.7	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
RPS2-215	ENST00000533872	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		31.7	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	ZPR1	O75312	459 aa		31.69	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	GYS1	P13807	737 aa		31.69	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	31.69	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	MYL6B	P14649	208 aa		31.68	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		31.68	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		31.68	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	PROSER3	Q2NL68	480 aa		31.67	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		31.67	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	PTGER2	P43116	358 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	MSL1	Q68DK7	614 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	ANXA1	P04083	346 aa		31.64	■■■□□ 2.66
RPS2-215	ENST00000533872	VAMP4	O75379	141 aa		31.63	■■■□□ 2.65
RPS2-215	ENST00000533872	CAMTA2	O94983	1202 aa		31.63	■■■□□ 2.65
RPS2-215	ENST00000533872	POLD1	P28340	1107 aa		31.62	■■■□□ 2.65
RPS2-215	ENST00000533872	ARX	Q96QS3	562 aa		31.62	■■■□□ 2.65
RPS2-215	ENST00000533872	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		31.62	■■■□□ 2.65
RPS2-215	ENST00000533872	RGL2	O15211	777 aa		31.61	■■■□□ 2.65
RPS2-215	ENST00000533872	FKBP8	Q14318	412 aa		31.61	■■■□□ 2.65
RPS2-215	ENST00000533872	HYPK	Q9NX55	129 aa		31.61	■■■□□ 2.65
RPS2-215	ENST00000533872	CACNA1F	O60840	1977 aa		31.59	■■■□□ 2.65
RPS2-215	ENST00000533872	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		31.59	■■■□□ 2.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103 ms