RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PTPRK-218ENST00000525459 KCNQ4P56696 695 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRK-218ENST00000525459 AK7Q96M32 723 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRK-218ENST00000525459 ERBB4Q15303 1308 aa24.2■■□□□ 1.47
PTPRK-218ENST00000525459 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRK-218ENST00000525459 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PTPRK-218ENST00000525459 AKT1S1Q96B36 256 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRK-218ENST00000525459 C4AP0C0L4 1744 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRK-218ENST00000525459 SLC15A2Q16348 729 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRK-218ENST00000525459 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRK-218ENST00000525459 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRK-218ENST00000525459 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRK-218ENST00000525459 USP16Q9Y5T5 823 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRK-218ENST00000525459 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRK-218ENST00000525459 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRK-218ENST00000525459 ADRA2BP18089 450 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRK-218ENST00000525459 SSFA2P28290 1259 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF827Q17R98 1081 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRK-218ENST00000525459 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRK-218ENST00000525459 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRK-218ENST00000525459 CASZ1Q86V15 1759 aa24.14■■□□□ 1.46
PTPRK-218ENST00000525459 GNPATO15228 680 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 KRT24Q2M2I5 525 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 RPS6KA4O75676 772 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 BCORQ6W2J9 1755 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF428Q96B54 188 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 SCN7AQ01118 1682 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 COL15A1P39059 1388 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 TSPYL6Q8N831 410 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 A1BGP04217 495 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 A0A087WZG4 1122 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PTPRK-218ENST00000525459 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.08■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 STK31Q9BXU1 1019 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 VAMP4O75379 141 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 NBPF26B4DH59 902 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 PHF14O94880 888 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 NBPF15Q8N660 670 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 HYPKQ9NX55 129 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 RFC4P35249 363 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 PDIA6Q15084 440 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 NUP98P52948 1817 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 RGL2O15211 777 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 NECTIN2Q92692 538 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-218ENST00000525459 MYL6BP14649 208 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 LRP10Q7Z4F1 713 aa24■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 NARFQ9UHQ1 456 aa24■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 ZPR1O75312 459 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 MSH5O43196 834 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 PROSER3Q2NL68 480 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 SLC4A2P04920 1241 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-218ENST00000525459 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-218ENST00000525459 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-218ENST00000525459 ANXA1P04083 346 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-218ENST00000525459 MTFR1LQ9H019 292 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-218ENST00000525459 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRK-218ENST00000525459 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRK-218ENST00000525459 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRK-218ENST00000525459 COPS6Q7L5N1 327 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRK-218ENST00000525459 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRK-218ENST00000525459 ARXQ96QS3 562 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRK-218ENST00000525459 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.93■■□□□ 1.42
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