RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486115.1

C7orf49-210, humanhuman

TSL 2

Gene C7orf49, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-210ENST00000486115 ZNF827Q17R98 1081 aa23.52■■□□□ 1.36
C7orf49-210ENST00000486115 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
C7orf49-210ENST00000486115 GNPATO15228 680 aa23.51■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.51■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 USP16Q9Y5T5 823 aa23.5■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.5■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.49■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.49■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 SSFA2P28290 1259 aa23.48■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 SLFN5Q08AF3 891 aa23.48■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.48■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 RPS6KA4O75676 772 aa23.47■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 ADRA2BP18089 450 aa23.47■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 KRT24Q2M2I5 525 aa23.47■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 ERBB4Q15303 1308 aa23.47■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.46■■□□□ 1.35
C7orf49-210ENST00000486115 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.45■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 PHF14O94880 888 aa23.44■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 A1BGP04217 495 aa23.44■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.44■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.44■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.43■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.43■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 A0A087WZG4 1122 aa23.42■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.42■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 COL15A1P39059 1388 aa23.41■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.41■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 MSH5O43196 834 aa23.41■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.4■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 TSPYL6Q8N831 410 aa23.4■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
C7orf49-210ENST00000486115 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.39■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 RFC4P35249 363 aa23.39■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 NECTIN2Q92692 538 aa23.39■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 NBPF26B4DH59 902 aa23.38■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.38■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 NBPF15Q8N660 670 aa23.38■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.38■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 STK31Q9BXU1 1019 aa23.37■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 MYL6BP14649 208 aa23.36■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.36■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 ZPR1O75312 459 aa23.35■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 VAMP4O75379 141 aa23.35■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 HYPKQ9NX55 129 aa23.35■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 CASZ1Q86V15 1759 aa23.35■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 PDIA6Q15084 440 aa23.34■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 SMIM5Q71RC9 77 aa23.34■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 ZNF428Q96B54 188 aa23.34■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 ARXQ96QS3 562 aa23.33■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 NARFQ9UHQ1 456 aa23.33■■□□□ 1.33
C7orf49-210ENST00000486115 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.32■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 MTFR1LQ9H019 292 aa23.32■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 C4AP0C0L4 1744 aa23.31■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 PROSER3Q2NL68 480 aa23.31■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 ANXA1P04083 346 aa23.3■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 RGL2O15211 777 aa23.29■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.29■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.29■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.29■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 ZBTB7AO95365 584 aa23.28■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.28■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.28■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.28■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.27■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 CAMTA2O94983 1202 aa23.27■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 SLC4A2P04920 1241 aa23.27■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 GYS1P13807 737 aa23.27■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 COPS6Q7L5N1 327 aa23.27■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 SCN7AQ01118 1682 aa23.27■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.27■■□□□ 1.32
C7orf49-210ENST00000486115 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
C7orf49-210ENST00000486115 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.8 ms