RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465282.5

USP39-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 4

Gene USP39, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-211ENST00000465282 GNPATO15228 680 aa22.04■■□□□ 1.12
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USP39-211ENST00000465282 ADRA2BP18089 450 aa22.04■■□□□ 1.12
USP39-211ENST00000465282 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.04■■□□□ 1.12
USP39-211ENST00000465282 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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USP39-211ENST00000465282 MBIPQ9NS73 344 aa22.03■■□□□ 1.12
USP39-211ENST00000465282 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.03■■□□□ 1.12
USP39-211ENST00000465282 ZNF521Q96K83 1311 aa22.02■■□□□ 1.12
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USP39-211ENST00000465282 CHMP4AQ9BY43 222 aa22■■□□□ 1.11
USP39-211ENST00000465282 USP16Q9Y5T5 823 aa22■■□□□ 1.11
USP39-211ENST00000465282 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
USP39-211ENST00000465282 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
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USP39-211ENST00000465282 A0A087WZG4 1122 aa21.96■■□□□ 1.11
USP39-211ENST00000465282 PHF14O94880 888 aa21.96■■□□□ 1.11
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USP39-211ENST00000465282 C4AP0C0L4 1744 aa21.96■■□□□ 1.11
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USP39-211ENST00000465282 RFC4P35249 363 aa21.95■■□□□ 1.1
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USP39-211ENST00000465282 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
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USP39-211ENST00000465282 COL15A1P39059 1388 aa21.93■■□□□ 1.1
USP39-211ENST00000465282 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.93■■□□□ 1.1
USP39-211ENST00000465282 SPON1Q9HCB6 807 aa21.93■■□□□ 1.1
USP39-211ENST00000465282 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.93■■□□□ 1.1
USP39-211ENST00000465282 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.92■■□□□ 1.1
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USP39-211ENST00000465282 KRT24Q2M2I5 525 aa21.91■■□□□ 1.1
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USP39-211ENST00000465282 NBPF26B4DH59 902 aa21.9■■□□□ 1.1
USP39-211ENST00000465282 ZPR1O75312 459 aa21.9■■□□□ 1.1
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USP39-211ENST00000465282 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
USP39-211ENST00000465282 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
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USP39-211ENST00000465282 BCORQ6W2J9 1755 aa21.85■■□□□ 1.09
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USP39-211ENST00000465282 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.84■■□□□ 1.09
USP39-211ENST00000465282 MYL6BP14649 208 aa21.84■■□□□ 1.09
USP39-211ENST00000465282 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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USP39-211ENST00000465282 HYPKQ9NX55 129 aa21.84■■□□□ 1.09
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USP39-211ENST00000465282 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.83■■□□□ 1.09
USP39-211ENST00000465282 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.83■■□□□ 1.09
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USP39-211ENST00000465282 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.82■■□□□ 1.08
USP39-211ENST00000465282 VAMP4O75379 141 aa21.82■■□□□ 1.08
USP39-211ENST00000465282 ARXQ96QS3 562 aa21.82■■□□□ 1.08
USP39-211ENST00000465282 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.82■■□□□ 1.08
USP39-211ENST00000465282 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
USP39-211ENST00000465282 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.82■■□□□ 1.08
USP39-211ENST00000465282 CAMTA2O94983 1202 aa21.81■■□□□ 1.08
USP39-211ENST00000465282 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.81■■□□□ 1.08
USP39-211ENST00000465282 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.81■■□□□ 1.08
USP39-211ENST00000465282 STK31Q9BXU1 1019 aa21.81■■□□□ 1.08
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