RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa3.53□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 ABCC1P33527 1531 aa3.53□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 POTEFA5A3E0 1075 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 M0R2N6 131 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 SEMA3FQ13275 785 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 HLA-CQ95604 372 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PCDH12Q9NPG4 1184 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PPP4CP60510 307 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 IER5LQ5T953 404 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 FAM200AQ8TCP9 573 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PSMD1Q99460 953 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 POLR3GLQ9BT43 218 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 ACBD3Q9H3P7 528 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 USP32Q8NFA0 1604 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 LMTK2Q8IWU2 1503 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PLCH1Q4KWH8 1693 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 COL9A1P20849 921 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 MTMR2Q13614 643 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 FHOD3Q2V2M9 1422 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 NT5DC4Q86YG4 428 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 JMYQ8N9B5 988 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 CDCA7LQ96GN5 454 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 CEP126Q9P2H0 1117 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 NCOA2Q15596 1464 aa3.52□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 CHPF2Q9P2E5 772 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 VPS13CQ709C8 3753 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 SLC10A3P09131 477 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 CLEC4GQ6UXB4 293 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 CAPN12Q6ZSI9 719 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 RASGRP4Q8TDF6 673 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 MAP3K7O43318 606 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 C4orf46Q504U0 113 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 LYPD8Q6UX82 237 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 TEX2Q8IWB9 1127 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 OSBPL2Q9H1P3 480 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 ALS2Q96Q42 1657 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 MAFGO15525 162 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 FZD6O60353 706 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 GUCA2AQ02747 115 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 TSGA10IPQ3SY00 556 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 C9orf131Q5VYM1 1079 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PPP1R18Q6NYC8 613 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 RELTQ969Z4 430 aa3.51□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 ESPNB1AK53 854 aa3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 MSRB2Q9Y3D2 182 aa3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 IQGAP1P46940 1657 aa3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 NRAPQ86VF7 1730 aa3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 KCNQ2O43526 872 aa3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 POTEIP0CG38 1075 aa3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.855e-7■□□□□ 10.7
CCSAP-202ENST00000366686 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 SULF1Q8IWU6 871 aa3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 C12orf49Q9H741 205 aa3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 TNNI2P48788 182 aa3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 CITED4Q96RK1 184 aa3.5□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PRMT3O60678 531 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 EVA1CP58658 441 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 DPYDQ12882 1025 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 ADAM33Q9BZ11 813 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PARP2Q9UGN5 583 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PLA2R1Q13018 1463 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 KIF1AQ12756 1690 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 NALCNQ8IZF0 1738 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PRKD2Q9BZL6 878 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 TANGO6Q9C0B7 1094 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 OCEL1Q9H607 264 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM35Q9UPQ4 493 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 ZBBXA8MT70 800 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 KLF4O43474 513 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 NCOA4Q13772 614 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 SOGA3Q5TF21 947 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 MAP3K1Q13233 1512 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms