RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366672.4

GALNT2-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT2, Length 4,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT2-201ENST00000366672 IL27Q8NEV9 243 aa21.94■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 INSRP06213 1382 aa21.94■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 CEP89Q96ST8 783 aa21.94■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 CFAP45Q9UL16 551 aa21.94■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.93■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.93■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 ABCF2Q9UG63 623 aa21.93■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 ME1P48163 572 aa21.92■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.92■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.92■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 IP6K1Q92551 441 aa21.92■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.91■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 GPS2Q13227 327 aa21.91■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 NGLY1Q96IV0 654 aa21.91■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 KSR2Q6VAB6 950 aa21.91■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 HOXC9P31274 260 aa21.9■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 IL13P35225 146 aa21.9■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 ATP8B2P98198 1209 aa21.9■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 ZPR1O75312 459 aa21.9■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.9■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 TNNQ9UQP3 1299 aa21.9■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.9■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 TXLNAP40222 546 aa21.9■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 CCDC70Q6NSX1 233 aa21.9■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 COPS6Q7L5N1 327 aa21.9■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.9■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 SPATA32Q96LK8 384 aa21.9■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 MAP7D2Q96T17 732 aa21.9■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.89■■□□□ 1.1
GALNT2-201ENST00000366672 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.89■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 GPTP24298 496 aa21.89■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 SIRT1Q96EB6 747 aa21.89■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 TNMDQ9H2S6 317 aa21.89■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.89■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.88■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 SLC39A6Q13433 755 aa21.88■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.88■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 KLHL34Q8N239 644 aa21.88■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 MAP3K5Q99683 1374 aa21.88■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 MAP3K12Q12852 859 aa21.88■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.88■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 SMC5Q8IY18 1101 aa21.88■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 LINS1Q8NG48 757 aa21.88■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 PDE1AP54750 535 aa21.87■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 ESPNB1AK53 854 aa21.87■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 GRM8O00222 908 aa21.87■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 KRT24Q2M2I5 525 aa21.87■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 SDSP20132 328 aa21.87■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 DCTPP1Q9H773 170 aa21.87■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.86■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.86■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 SLC5A1P13866 664 aa21.86■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 DDX11Q96FC9 970 aa21.85■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.85■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 WASF1Q92558 559 aa21.85■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 SBNO1A3KN83 1393 aa21.84■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.84■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.84■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 NAPBQ9H115 298 aa21.84■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 MNS1Q8NEH6 495 aa21.84■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 FERMT3Q86UX7 667 aa21.83■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.83■■□□□ 1.09
GALNT2-201ENST00000366672 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.83■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.82■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.82■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 DCAF5Q96JK2 942 aa21.82■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 CEP85Q6P2H3 762 aa21.82■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.82■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 GOLIM4O00461 696 aa21.81■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 KDM6BO15054 1643 aa21.81■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 ATP2B2Q01814 1243 aa21.81■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 C8orf34Q49A92 452 aa21.81■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.81■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 CHL1O00533 1208 aa21.8■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 ZNF213O14771 459 aa21.8■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.8■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 IL2RBP14784 551 aa21.8■■□□□ 1.08
GALNT2-201ENST00000366672 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms