RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.96■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 TCHHQ07283 1943 aa20.96■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 SSH3Q8TE77 659 aa20.96■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 NLRP6P59044 892 aa20.95■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.95■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.95■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.94■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 IL17RAQ96F46 866 aa20.94■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.94■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 PIK3C2AO00443 1686 aa20.94■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 RASEFQ8IZ41 740 aa20.93■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.93■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 MAP3K5Q99683 1374 aa20.93■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 CPA1P15085 419 aa20.93■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 HOXC9P31274 260 aa20.93■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.93■□□□□ 0.94
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PDE4A-201ENST00000293683 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.92■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 RAD50Q92878 1312 aa20.92■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 NWD1Q149M9 1564 aa20.92■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 SGSM2O43147 1006 aa20.92■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.92■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 SPG7Q9UQ90 795 aa20.92■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 AOX1Q06278 1338 aa20.91■□□□□ 0.94
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PDE4A-201ENST00000293683 UQCRHP07919 91 aa20.91■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.91■□□□□ 0.94
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PDE4A-201ENST00000293683 AK2P54819 239 aa20.91■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 ANXA1P04083 346 aa20.9■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 TTC14Q96N46 770 aa20.9■□□□□ 0.94
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PDE4A-201ENST00000293683 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.9■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 POLA2Q14181 598 aa20.9■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 RUFY3Q7L099 469 aa20.9■□□□□ 0.94
PDE4A-201ENST00000293683 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.94
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PDE4A-201ENST00000293683 LARGE1O95461 756 aa20.89■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 TERF1P54274 439 aa20.89■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 USP25Q9UHP3 1055 aa20.88■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 ZMYND15Q9H091 742 aa20.88■□□□□ 0.93
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PDE4A-201ENST00000293683 SYT1P21579 422 aa20.87■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 CACNA1FO60840 1977 aa20.86■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.86■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 KCNQ3O43525 872 aa20.86■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.86■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 FIBPO43427 364 aa20.86■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.86■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 LGR6Q9HBX8 967 aa20.86■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 PHF14O94880 888 aa20.85■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 CNTROBQ8N137 903 aa20.85■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 STX6O43752 255 aa20.85■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
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PDE4A-201ENST00000293683 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.84■□□□□ 0.93
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PDE4A-201ENST00000293683 ABTB2Q8N961 1025 aa20.84■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.84■□□□□ 0.93
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PDE4A-201ENST00000293683 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.83■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.83■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 C14orf37Q86TY3 774 aa20.83■□□□□ 0.93
PDE4A-201ENST00000293683 ARID3AQ99856 593 aa20.83■□□□□ 0.93
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PDE4A-201ENST00000293683 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PDE4A-201ENST00000293683 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.82■□□□□ 0.92
PDE4A-201ENST00000293683 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.82■□□□□ 0.92
PDE4A-201ENST00000293683 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PDE4A-201ENST00000293683 F13A1P00488 732 aa20.82■□□□□ 0.92
PDE4A-201ENST00000293683 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PDE4A-201ENST00000293683 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.82■□□□□ 0.92
PDE4A-201ENST00000293683 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PDE4A-201ENST00000293683 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PDE4A-201ENST00000293683 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PDE4A-201ENST00000293683 EID1Q9Y6B2 187 aa20.81■□□□□ 0.92
PDE4A-201ENST00000293683 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.81■□□□□ 0.92
PDE4A-201ENST00000293683 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
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