RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271526.8

PRCC-201, Transcript of proline rich mitotic checkpoint control factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRCC, Length 2,105 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCC-201ENST00000271526 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.07■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.07■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 RNF214Q8ND24 703 aa21.07■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 GNAI3P08754 354 aa21.06■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 ATP8B2P98198 1209 aa21.06■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 STK31Q9BXU1 1019 aa21.06■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.05■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 KLHL34Q8N239 644 aa21.05■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.05■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.05■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.05■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.05■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 NLRP6P59044 892 aa21.04■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 FLIIQ13045 1269 aa21.04■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 MAP3K5Q99683 1374 aa21.04■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 SOX12O15370 315 aa21.04■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 IL17REQ8NFR9 667 aa21.04■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.04■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.03■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 HSPA4P34932 840 aa21.03■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 USP48Q86UV5 1035 aa21.02■□□□□ 0.96
PRCC-201ENST00000271526 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.02■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.01■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 TCHHQ07283 1943 aa21■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 RILPL2Q969X0 211 aa21■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.99■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.99■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 KCNA6P17658 529 aa20.99■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.99■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 MYRIPQ8NFW9 859 aa20.98■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 IL25Q9H293 177 aa20.98■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 RAD50Q92878 1312 aa20.98■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.97■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.97■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 TTC14Q96N46 770 aa20.97■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 SSH3Q8TE77 659 aa20.96■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 USP44Q9H0E7 712 aa20.96■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.96■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 HOXB7P09629 217 aa20.96■□□□□ 0.95
PRCC-201ENST00000271526 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.95■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 NFAT5O94916 1531 aa20.95■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 RAB11FIP3O75154 756 aa20.95■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 UBE2HP62256 183 aa20.95■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 ABTB2Q8N961 1025 aa20.95■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 IP6K1Q92551 441 aa20.95■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 SGSM2O43147 1006 aa20.94■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.93■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 SPTLC3Q9NUV7 552 aa20.93■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.93■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 USP25Q9UHP3 1055 aa20.93■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.93■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 POLA2Q14181 598 aa20.92■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.92■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.92■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 ADCY5O95622 1261 aa20.91■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.91■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 PRDM4Q9UKN5 801 aa20.91■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.91■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 STX6O43752 255 aa20.9■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 LTN1O94822 1766 aa20.9■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.9■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 F13A1P00488 732 aa20.9■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.9■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.9■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 NCAPD2Q15021 1401 aa20.89■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 SYT1P21579 422 aa20.89■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 AK2P54819 239 aa20.89■□□□□ 0.94
PRCC-201ENST00000271526 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PRCC-201ENST00000271526 KDM4AO75164 1064 aa20.89■□□□□ 0.93
PRCC-201ENST00000271526 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PRCC-201ENST00000271526 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PRCC-201ENST00000271526 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.89■□□□□ 0.93
PRCC-201ENST00000271526 RUFY3Q7L099 469 aa20.89■□□□□ 0.93
PRCC-201ENST00000271526 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.9 ms