RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Srgap3Q812A2 1099 aa24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 FanclQ9CR14 375 aa24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zap70P43404 618 aa24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nphp1Q9QY53 687 aa24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mmp8O70138 465 aa24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hspa1lP16627 641 aa24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mum1Q6DID5 682 aa24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cog6Q8R3I3 657 aa24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sik1Q60670 779 aa24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ppm1mQ8BU27 406 aa24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trim52Q8CDV4 233 aa24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ankle2Q6P1H6 964 aa24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pm20d1Q8C165 503 aa24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa24.83■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atg4aQ8C9S8 396 aa24.83■■□□□ 1.57
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ier5O89113 308 aa24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cwc27Q3TKY6 469 aa24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ppm1gQ61074 542 aa24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mylk2Q8VCR8 613 aa24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mast2Q60592 1734 aa24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Igfbp6P47880 238 aa24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vps33bP59016 617 aa24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mcmdc2E9Q956 681 aa24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 ApobrQ8VBT6 942 aa24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tceal9Q9DD24 104 aa24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cacna1sQ02789 1880 aa24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Exoc5Q3TPX4 708 aa24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ankrd23Q812A3 306 aa24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nwd2Q6P5U7 1742 aa24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nav1Q8CH77 1875 aa24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ttll7A4Q9F0 912 aa24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ccdc146E9Q9F7 977 aa24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nkx1-2P42580 305 aa24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ccdc129Q14B48 1034 aa24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Grm8P47743 908 aa24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc39a6Q8C145 765 aa24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tlr7P58681 1050 aa24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 MypnQ5DTJ9 1315 aa24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CenppQ9CZ92 286 aa24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Map3k13Q1HKZ5 959 aa24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ddx58Q6Q899 926 aa24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa24.73■■□□□ 1.55
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kndc1Q0KK55 1742 aa24.72■■□□□ 1.55
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Col4a1P02463 1669 aa24.72■■□□□ 1.55
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa24.72■■□□□ 1.55
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 VgfQ0VGU4 617 aa24.71■■□□□ 1.55
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm12185Q5NCB2 835 aa24.71■■□□□ 1.55
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cap2Q9CYT6 476 aa24.71■■□□□ 1.55
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dnai1Q8C0M8 701 aa24.71■■□□□ 1.55
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ank1Q02357 1862 aa24.7■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tgfb1i1Q62219 461 aa24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ripor2Q80U16 1078 aa24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Emilin2Q8K482 1074 aa24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Syde2E9PUP1 1314 aa24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rabep1O35551 862 aa24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CanxP35564 591 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cct4P80315 539 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ggt6Q6PDE7 497 aa24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nek4Q9Z1J2 792 aa24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pde4dQ01063 747 aa24.68■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Psrc1Q9D0P7 329 aa24.68■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zkscan2G3X952 960 aa24.67■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa24.67■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Jmjd4Q8BFT6 427 aa24.67■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mrc1Q61830 1456 aa24.67■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 ChgaP26339 463 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Abcc4E9Q236 1325 aa24.67■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fkbp5Q64378 456 aa24.65■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nlrp9bQ66X22 1003 aa24.65■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dcaf5Q80T85 946 aa24.65■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 AbraQ8BUZ1 375 aa24.65■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Casz1Q9CWL2 1761 aa24.64■■□□□ 1.53
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hspa2P17156 633 aa24.64■■□□□ 1.53
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Bcar3Q9QZK2 820 aa24.64■■□□□ 1.53
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sos2Q02384 1333 aa24.63■■□□□ 1.53
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa24.63■■□□□ 1.53
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ehd4Q9EQP2 541 aa24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.6 ms