RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040580.6

Syde1-201, Transcript of Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Syde1, Length 3,288 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ppfibp2O35711 882 aa23.02■■□□□ 1.28
Syde1-201ENSMUST00000040580 Jarid2Q62315 1234 aa23.02■■□□□ 1.28
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gm12185Q5NCB2 835 aa23.02■■□□□ 1.28
Syde1-201ENSMUST00000040580 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa23.01■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Phf23Q8BSN5 401 aa23.01■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Lrit1Q8K099 624 aa23.01■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Flt4P35917 1363 aa23.01■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Vps33bP59016 617 aa23■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Zbtb1Q91VL9 713 aa23■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa23■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Strn4P58404 760 aa22.99■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa22.99■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Fbxo41Q6NS60 873 aa22.99■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa22.99■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Anp32aO35381 247 aa22.99■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 NmiO35309 314 aa22.98■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 MpndQ3TV65 487 aa22.98■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 PappaQ8R4K8 1624 aa22.97■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Cwc27Q3TKY6 469 aa22.97■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Fam13aQ8BGI4 693 aa22.96■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Igflr1Q3U4N7 345 aa22.96■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Trim27Q62158 513 aa22.96■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Srgap3Q812A2 1099 aa22.96■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Aldh1l2Q8K009 923 aa22.95■■□□□ 1.27
Syde1-201ENSMUST00000040580 Shank3Q4ACU6 1730 aa22.95■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 BcorQ8CGN4 1759 aa22.95■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa22.94■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ppm1mQ8BU27 406 aa22.94■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa22.94■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 MypnQ5DTJ9 1315 aa22.94■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ankle2Q6P1H6 964 aa22.93■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa22.93■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Trim52Q8CDV4 233 aa22.93■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Soga3Q6NZL0 945 aa22.92■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Tgfb1i1Q62219 461 aa22.92■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Tm6sf1P58749 370 aa22.91■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 FanclQ9CR14 375 aa22.91■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 EspnQ9ET47 871 aa22.91■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa22.91■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Fkbp5Q64378 456 aa22.91■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa22.9■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Nav1Q8CH77 1875 aa22.9■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ccdc146E9Q9F7 977 aa22.9■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Fbln2P37889 1221 aa22.9■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Liat1Q810M6 228 aa22.89■■□□□ 1.26
Syde1-201ENSMUST00000040580 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa22.89■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Mylk2Q8VCR8 613 aa22.89■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Grm8P47743 908 aa22.88■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 SkilQ60665 675 aa22.88■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa22.88■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa22.88■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Smarcc1P97496 1104 aa22.88■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Pde4dQ01063 747 aa22.87■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 CanxP35564 591 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 BcanQ61361 883 aa22.85■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gm13023A2A8N2 498 aa22.85■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 GalcP54818 684 aa22.85■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Arhgap33Q80YF9 1305 aa22.85■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 HellsQ60848 821 aa22.84■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Trim30dE9PWL0 497 aa22.84■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ier5O89113 308 aa22.84■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Myd88P22366 296 aa22.84■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa22.84■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Trip6Q9Z1Y4 480 aa22.84■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Golgb1E9PVZ8 3238 aa22.83■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Atp8b2P98199 1209 aa22.83■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Stk36Q69ZM6 1316 aa22.83■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 AampJ3QN89 436 aa22.83■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ripor2Q80U16 1078 aa22.83■■□□□ 1.25
Syde1-201ENSMUST00000040580 Morc2aQ69ZX6 1030 aa22.83■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 Prr5lA2AVJ5 370 aa22.82■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 GpkowQ56A08 488 aa22.82■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ttc19Q8CC21 365 aa22.82■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 Nphp1Q9QY53 687 aa22.82■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ddx58Q6Q899 926 aa22.81■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa22.81■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 GptQ8QZR5 496 aa22.81■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 Slf2Q6P9P0 1278 aa22.8■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 Atl3Q91YH5 541 aa22.8■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 Erbb4Q61527 1308 aa22.8■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 Adora1Q60612 326 aa22.79■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa22.79■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 Tceal9Q9DD24 104 aa22.79■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 MetP16056 1379 aa22.79■■□□□ 1.24
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ets1P27577 440 aa22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.7 ms