RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026252.13

Ldb1-201, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 1,718 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mmp8O70138 465 aa23.44■■□□□ 1.34
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 CanxP35564 591 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atg4aQ8C9S8 396 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 ChgaP26339 463 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mum1Q6DID5 682 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ddx60E9PZQ1 1711 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kat6bQ8BRB7 1872 aa23.41■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nkx1-2P42580 305 aa23.41■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tceal9Q9DD24 104 aa23.41■■□□□ 1.34
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ier5O89113 308 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Crb1Q8VHS2 1405 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ginm1Q91WR6 327 aa23.39■■□□□ 1.34
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Map3k13Q1HKZ5 959 aa23.39■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Dnai1Q8C0M8 701 aa23.39■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mcmdc2E9Q956 681 aa23.38■■□□□ 1.33
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sik1Q60670 779 aa23.38■■□□□ 1.33
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 ApobrQ8VBT6 942 aa23.38■■□□□ 1.33
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc39a6Q8C145 765 aa23.37■■□□□ 1.33
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cers3Q1A3B0 383 aa23.36■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ppm1mQ8BU27 406 aa23.36■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Trim52Q8CDV4 233 aa23.36■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ttll7A4Q9F0 912 aa23.35■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Grm8P47743 908 aa23.35■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nek4Q9Z1J2 792 aa23.35■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa23.34■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa23.34■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rabep1O35551 862 aa23.33■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 CenppQ9CZ92 286 aa23.33■■□□□ 1.33
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Exoc5Q3TPX4 708 aa23.33■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa23.33■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa23.33■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Lrp6O88572 1613 aa23.32■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pm20d1Q8C165 503 aa23.32■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ddx58Q6Q899 926 aa23.31■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mylk2Q8VCR8 613 aa23.31■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ggt6Q6PDE7 497 aa23.3■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa23.3■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ankrd23Q812A3 306 aa23.3■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 MypnQ5DTJ9 1315 aa23.29■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Fer1l6E0CZ42 1862 aa23.29■■□□□ 1.32
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zkscan2G3X952 960 aa23.29■■□□□ 1.32
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa23.28■■□□□ 1.32
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mast2Q60592 1734 aa23.28■■□□□ 1.32
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 VgfQ0VGU4 617 aa23.28■■□□□ 1.32
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa23.28■■□□□ 1.32
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm12185Q5NCB2 835 aa23.27■■□□□ 1.32
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa23.26■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Syde2E9PUP1 1314 aa23.26■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Col4a1P02463 1669 aa23.25■■□□□ 1.31
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nlrp9bQ66X22 1003 aa23.21■■□□□ 1.31
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Abcc4E9Q236 1325 aa23.21■■□□□ 1.31
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Dcaf5Q80T85 946 aa23.2■■□□□ 1.3
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ppp6r3Q922D4 844 aa23.2■■□□□ 1.3
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Q9D2X8 372 aa23.2■■□□□ 1.3
Ldb1-201ENSMUST00000026252 InsrrQ9WTL4 1300 aa23.2■■□□□ 1.3
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa23.2■■□□□ 1.3
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ank1Q02357 1862 aa23.2■■□□□ 1.3
Ldb1-201ENSMUST00000026252 NmiO35309 314 aa23.19■■□□□ 1.3
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
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