RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000017552.12

Cacnb1-201, Transcript of Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cacnb1, Length 3,396 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Cops4O88544 406 aa14.49□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Rab12P35283 243 aa14.49□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Zscan26Q5RJ54 466 aa14.49□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Tusc1Q673H1 205 aa14.49□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 MyorgQ69ZQ1 716 aa14.49□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 PdprQ7TSQ8 878 aa14.49□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Scn3bQ8BHK2 215 aa14.49□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Gykl1Q8C635 549 aa14.49□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Fbxl22Q8C7B6 236 aa14.49□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Rcor1Q8CFE3 480 aa14.49□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 St7lQ8K4P7 559 aa14.49□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Cd209aQ91ZX1 238 aa14.49□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 CutalQ9D1U5 156 aa14.49□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Csnk1dQ9DC28 415 aa14.49□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Pbld1Q9DCG6 288 aa14.49□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Vmn1r65Q9EPS7 332 aa14.49□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Il21Q9ES17 146 aa14.49□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Hapln1Q9QUP5 356 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Gm6685D3YYP3 228 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Gm340F6RGI3 1242 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Gm3159K7N760 267 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Slc16a8O35308 492 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Matn4O89029 624 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 CidecP56198 239 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Pde7aP70453 456 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Anxa4P97429 319 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Nell1Q2VWQ2 810 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Txndc15Q6P6J9 344 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Hmbox1Q8BJA3 419 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Gramd1cQ8CI52 457 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Fmo2Q8K2I3 535 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Ahi1Q8K3E5 1047 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Zcchc9Q8R1J3 271 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 St3gal4Q91Y74 333 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Mthfd1Q922D8 935 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 FopnlQ9CZS3 174 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Olfr1306A2BFL7 312 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Vmn2r85G3UW56 850 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Adrb1P34971 466 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Ppm1aP49443 382 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Fam167aQ6P1G6 215 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Ctdsp2Q8BX07 270 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Pbx4Q99NE9 378 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 NwcQ9CQI4 244 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Kdelr2Q9CQM2 212 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Nudt17Q9CWD3 296 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Hmg20aQ9DC33 346 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Cldn8Q9Z260 225 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Upk1bQ9Z2C6 260 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Scn5aQ9JJV9 2019 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Olfr316A0A0N4SVP2 306 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 A6H6Q4 206 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Olfr543E9PWI5 336 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Vmn2r10K7N621 847 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Phox2bO35690 314 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Bmp4P21275 408 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Mkl2P59759 1080 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Scgb1a1Q06318 96 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Plpp4Q0VBU9 271 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 CamkmtQ3U2J5 323 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Olfr318Q5NCD7 306 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 RimklaQ6PFX8 380 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Coq4Q8BGB8 266 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Mief1Q8BGV8 463 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Fam155aQ8CCS2 467 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Akr1d1Q8VCX1 325 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Olfr1461Q8VEV7 312 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Olfr854Q8VFF1 315 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Olfr342Q8VGK7 312 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Eif2b2Q99LD9 351 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Tmem269Q9D4Y8 254 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Q9DAY5 185 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Trim39Q9ESN2 488 aa14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 FarsbQ9WUA2 589 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 PtprfA2A8L5 1898 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Zfp758E9QAA1 583 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Gm8926L7MUE8 181 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Hoxc11P31313 304 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Gbx2P48031 348 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Pkp4Q68FH0 1190 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Atp11bQ6DFW5 1175 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 ManealQ6P1J0 452 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 ToporsQ80Z37 1033 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Zbtb46Q8BID6 600 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Cers6Q8C172 384 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Dpep2Q8C255 478 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Slc45a3Q8K0H7 553 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Slc8a2Q8K596 921 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Olfr985Q8VGB4 311 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 BollQ924M5 281 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Trim12aQ99PQ1 284 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Dppa5aQ9CQS7 118 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Hspb3Q9QZ57 154 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Vps29Q9QZ88 182 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 PpigA2AR02 752 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Olfr742A2RTP5 311 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Olfr171G5E8J1 314 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Sult3a1O35403 293 aa14.47□□□□□ -0.09
Cacnb1-201ENSMUST00000017552 Znf143O70230 638 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 110 ms