Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHK2

Scn3b, Sodium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3bQ8BHK2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Scn3bQ8BHK2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Scn3bQ8BHK2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Scn3bQ8BHK2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Scn3bQ8BHK2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Scn3bQ8BHK2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Scn3bQ8BHK2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Scn3bQ8BHK2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Scn3bQ8BHK2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Scn3bQ8BHK2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scn3bQ8BHK2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Scn3bQ8BHK2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scn3bQ8BHK2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scn3bQ8BHK2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scn3bQ8BHK2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Scn3bQ8BHK2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Scn3bQ8BHK2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scn3bQ8BHK2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scn3bQ8BHK2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Scn3bQ8BHK2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scn3bQ8BHK2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scn3bQ8BHK2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scn3bQ8BHK2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scn3bQ8BHK2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn3bQ8BHK2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn3bQ8BHK2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scn3bQ8BHK2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Scn3bQ8BHK2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scn3bQ8BHK2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scn3bQ8BHK2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Scn3bQ8BHK2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scn3bQ8BHK2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scn3bQ8BHK2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scn3bQ8BHK2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Scn3bQ8BHK2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scn3bQ8BHK2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scn3bQ8BHK2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scn3bQ8BHK2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scn3bQ8BHK2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scn3bQ8BHK2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn3bQ8BHK2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scn3bQ8BHK2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Scn3bQ8BHK2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scn3bQ8BHK2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scn3bQ8BHK2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn3bQ8BHK2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scn3bQ8BHK2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scn3bQ8BHK2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scn3bQ8BHK2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scn3bQ8BHK2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn3bQ8BHK2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scn3bQ8BHK2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scn3bQ8BHK2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scn3bQ8BHK2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Scn3bQ8BHK2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scn3bQ8BHK2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn3bQ8BHK2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn3bQ8BHK2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scn3bQ8BHK2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scn3bQ8BHK2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scn3bQ8BHK2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Scn3bQ8BHK2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scn3bQ8BHK2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scn3bQ8BHK2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scn3bQ8BHK2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scn3bQ8BHK2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Scn3bQ8BHK2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scn3bQ8BHK2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn3bQ8BHK2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn3bQ8BHK2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn3bQ8BHK2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scn3bQ8BHK2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scn3bQ8BHK2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scn3bQ8BHK2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scn3bQ8BHK2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Scn3bQ8BHK2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scn3bQ8BHK2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scn3bQ8BHK2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scn3bQ8BHK2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scn3bQ8BHK2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scn3bQ8BHK2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scn3bQ8BHK2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn3bQ8BHK2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn3bQ8BHK2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn3bQ8BHK2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn3bQ8BHK2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn3bQ8BHK2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn3bQ8BHK2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn3bQ8BHK2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn3bQ8BHK2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn3bQ8BHK2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn3bQ8BHK2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scn3bQ8BHK2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scn3bQ8BHK2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scn3bQ8BHK2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn3bQ8BHK2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn3bQ8BHK2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scn3bQ8BHK2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn3bQ8BHK2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scn3bQ8BHK2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms