Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ57

Hspb3, Heat shock protein beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb3Q9QZ57 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Hspb3Q9QZ57 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Hspb3Q9QZ57 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Hspb3Q9QZ57 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Hspb3Q9QZ57 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Hspb3Q9QZ57 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Hspb3Q9QZ57 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Hspb3Q9QZ57 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Hspb3Q9QZ57 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Hspb3Q9QZ57 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Hspb3Q9QZ57 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hspb3Q9QZ57 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Hspb3Q9QZ57 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Hspb3Q9QZ57 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hspb3Q9QZ57 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hspb3Q9QZ57 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hspb3Q9QZ57 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hspb3Q9QZ57 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hspb3Q9QZ57 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hspb3Q9QZ57 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hspb3Q9QZ57 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hspb3Q9QZ57 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hspb3Q9QZ57 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hspb3Q9QZ57 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hspb3Q9QZ57 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hspb3Q9QZ57 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hspb3Q9QZ57 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Hspb3Q9QZ57 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Hspb3Q9QZ57 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hspb3Q9QZ57 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hspb3Q9QZ57 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hspb3Q9QZ57 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hspb3Q9QZ57 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hspb3Q9QZ57 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hspb3Q9QZ57 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hspb3Q9QZ57 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hspb3Q9QZ57 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hspb3Q9QZ57 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hspb3Q9QZ57 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Hspb3Q9QZ57 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hspb3Q9QZ57 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hspb3Q9QZ57 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hspb3Q9QZ57 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hspb3Q9QZ57 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hspb3Q9QZ57 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Hspb3Q9QZ57 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hspb3Q9QZ57 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hspb3Q9QZ57 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hspb3Q9QZ57 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hspb3Q9QZ57 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hspb3Q9QZ57 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hspb3Q9QZ57 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hspb3Q9QZ57 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hspb3Q9QZ57 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hspb3Q9QZ57 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hspb3Q9QZ57 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Hspb3Q9QZ57 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hspb3Q9QZ57 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hspb3Q9QZ57 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hspb3Q9QZ57 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hspb3Q9QZ57 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hspb3Q9QZ57 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hspb3Q9QZ57 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hspb3Q9QZ57 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hspb3Q9QZ57 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Hspb3Q9QZ57 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hspb3Q9QZ57 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hspb3Q9QZ57 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hspb3Q9QZ57 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Hspb3Q9QZ57 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hspb3Q9QZ57 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Hspb3Q9QZ57 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hspb3Q9QZ57 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hspb3Q9QZ57 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hspb3Q9QZ57 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hspb3Q9QZ57 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hspb3Q9QZ57 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hspb3Q9QZ57 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Hspb3Q9QZ57 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hspb3Q9QZ57 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hspb3Q9QZ57 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hspb3Q9QZ57 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hspb3Q9QZ57 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hspb3Q9QZ57 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hspb3Q9QZ57 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hspb3Q9QZ57 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hspb3Q9QZ57 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hspb3Q9QZ57 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hspb3Q9QZ57 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hspb3Q9QZ57 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hspb3Q9QZ57 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hspb3Q9QZ57 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hspb3Q9QZ57 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hspb3Q9QZ57 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hspb3Q9QZ57 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hspb3Q9QZ57 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hspb3Q9QZ57 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hspb3Q9QZ57 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hspb3Q9QZ57 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hspb3Q9QZ57 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms