Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Hoxc11P31313 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Hoxc11P31313 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Hoxc11P31313 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Hoxc11P31313 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Hoxc11P31313 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Hoxc11P31313 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Hoxc11P31313 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Hoxc11P31313 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Hoxc11P31313 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Hoxc11P31313 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Hoxc11P31313 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Hoxc11P31313 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Hoxc11P31313 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Hoxc11P31313 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Hoxc11P31313 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hoxc11P31313 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hoxc11P31313 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Hoxc11P31313 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Hoxc11P31313 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hoxc11P31313 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Hoxc11P31313 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hoxc11P31313 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxc11P31313 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hoxc11P31313 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hoxc11P31313 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxc11P31313 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hoxc11P31313 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hoxc11P31313 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxc11P31313 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hoxc11P31313 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hoxc11P31313 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hoxc11P31313 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hoxc11P31313 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxc11P31313 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Hoxc11P31313 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Hoxc11P31313 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hoxc11P31313 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hoxc11P31313 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hoxc11P31313 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hoxc11P31313 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hoxc11P31313 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hoxc11P31313 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hoxc11P31313 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxc11P31313 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxc11P31313 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxc11P31313 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxc11P31313 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hoxc11P31313 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hoxc11P31313 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxc11P31313 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hoxc11P31313 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hoxc11P31313 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxc11P31313 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxc11P31313 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxc11P31313 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Hoxc11P31313 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxc11P31313 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc11P31313 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxc11P31313 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxc11P31313 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxc11P31313 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxc11P31313 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxc11P31313 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxc11P31313 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxc11P31313 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxc11P31313 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxc11P31313 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxc11P31313 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxc11P31313 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxc11P31313 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxc11P31313 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxc11P31313 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxc11P31313 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxc11P31313 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxc11P31313 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxc11P31313 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxc11P31313 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxc11P31313 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxc11P31313 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxc11P31313 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxc11P31313 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxc11P31313 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxc11P31313 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxc11P31313 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxc11P31313 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxc11P31313 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxc11P31313 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxc11P31313 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxc11P31313 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxc11P31313 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxc11P31313 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxc11P31313 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxc11P31313 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Hoxc11P31313 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxc11P31313 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxc11P31313 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxc11P31313 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxc11P31313 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxc11P31313 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 318.2 ms