Protein–RNA interactions for Protein: Q06318

Scgb1a1, Uteroglobin, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb1a1Q06318 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Scgb1a1Q06318 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Scgb1a1Q06318 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Scgb1a1Q06318 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Scgb1a1Q06318 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Scgb1a1Q06318 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Scgb1a1Q06318 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Scgb1a1Q06318 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Scgb1a1Q06318 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scgb1a1Q06318 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Scgb1a1Q06318 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Scgb1a1Q06318 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Scgb1a1Q06318 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Scgb1a1Q06318 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scgb1a1Q06318 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scgb1a1Q06318 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Scgb1a1Q06318 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Scgb1a1Q06318 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scgb1a1Q06318 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Scgb1a1Q06318 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scgb1a1Q06318 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scgb1a1Q06318 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scgb1a1Q06318 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scgb1a1Q06318 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scgb1a1Q06318 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Scgb1a1Q06318 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scgb1a1Q06318 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scgb1a1Q06318 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scgb1a1Q06318 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scgb1a1Q06318 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Scgb1a1Q06318 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scgb1a1Q06318 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Scgb1a1Q06318 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scgb1a1Q06318 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scgb1a1Q06318 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scgb1a1Q06318 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scgb1a1Q06318 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scgb1a1Q06318 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scgb1a1Q06318 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Scgb1a1Q06318 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scgb1a1Q06318 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scgb1a1Q06318 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Scgb1a1Q06318 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scgb1a1Q06318 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scgb1a1Q06318 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scgb1a1Q06318 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scgb1a1Q06318 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scgb1a1Q06318 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scgb1a1Q06318 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scgb1a1Q06318 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scgb1a1Q06318 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scgb1a1Q06318 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scgb1a1Q06318 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scgb1a1Q06318 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Scgb1a1Q06318 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scgb1a1Q06318 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scgb1a1Q06318 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scgb1a1Q06318 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scgb1a1Q06318 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scgb1a1Q06318 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scgb1a1Q06318 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scgb1a1Q06318 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scgb1a1Q06318 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Scgb1a1Q06318 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scgb1a1Q06318 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scgb1a1Q06318 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scgb1a1Q06318 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Scgb1a1Q06318 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scgb1a1Q06318 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scgb1a1Q06318 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scgb1a1Q06318 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scgb1a1Q06318 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scgb1a1Q06318 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scgb1a1Q06318 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scgb1a1Q06318 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Scgb1a1Q06318 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scgb1a1Q06318 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scgb1a1Q06318 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scgb1a1Q06318 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scgb1a1Q06318 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scgb1a1Q06318 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scgb1a1Q06318 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scgb1a1Q06318 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scgb1a1Q06318 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scgb1a1Q06318 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scgb1a1Q06318 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scgb1a1Q06318 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scgb1a1Q06318 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scgb1a1Q06318 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scgb1a1Q06318 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scgb1a1Q06318 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scgb1a1Q06318 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scgb1a1Q06318 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scgb1a1Q06318 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scgb1a1Q06318 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scgb1a1Q06318 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scgb1a1Q06318 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scgb1a1Q06318 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scgb1a1Q06318 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scgb1a1Q06318 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms