Protein–RNA interactions for Protein: O89029

Matn4, Matrilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn4O89029 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Matn4O89029 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Matn4O89029 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Matn4O89029 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Matn4O89029 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Matn4O89029 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Matn4O89029 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Matn4O89029 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Matn4O89029 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Matn4O89029 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Matn4O89029 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Matn4O89029 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Matn4O89029 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Matn4O89029 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Matn4O89029 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Matn4O89029 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Matn4O89029 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Matn4O89029 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Matn4O89029 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Matn4O89029 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Matn4O89029 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Matn4O89029 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Matn4O89029 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Matn4O89029 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Matn4O89029 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Matn4O89029 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Matn4O89029 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Matn4O89029 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Matn4O89029 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Matn4O89029 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Matn4O89029 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Matn4O89029 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Matn4O89029 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Matn4O89029 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Matn4O89029 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Matn4O89029 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Matn4O89029 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Matn4O89029 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Matn4O89029 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Matn4O89029 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Matn4O89029 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Matn4O89029 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Matn4O89029 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Matn4O89029 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Matn4O89029 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Matn4O89029 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Matn4O89029 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Matn4O89029 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Matn4O89029 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Matn4O89029 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Matn4O89029 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Matn4O89029 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Matn4O89029 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Matn4O89029 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Matn4O89029 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Matn4O89029 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Matn4O89029 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Matn4O89029 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Matn4O89029 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Matn4O89029 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Matn4O89029 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Matn4O89029 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Matn4O89029 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Matn4O89029 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Matn4O89029 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Matn4O89029 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Matn4O89029 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Matn4O89029 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Matn4O89029 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Matn4O89029 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Matn4O89029 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Matn4O89029 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Matn4O89029 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Matn4O89029 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Matn4O89029 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Matn4O89029 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Matn4O89029 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Matn4O89029 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Matn4O89029 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Matn4O89029 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Matn4O89029 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Matn4O89029 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Matn4O89029 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Matn4O89029 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Matn4O89029 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Matn4O89029 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Matn4O89029 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Matn4O89029 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Matn4O89029 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Matn4O89029 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Matn4O89029 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Matn4O89029 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Matn4O89029 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Matn4O89029 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Matn4O89029 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Matn4O89029 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Matn4O89029 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Matn4O89029 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Matn4O89029 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Matn4O89029 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms