RNA–Protein interactions for RNA: YOL077C

BRX1, Transcript of Nucleolar protein, yeastyeast

Gene BRX1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRX1YOL077C TIF35Q04067 274 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
BRX1YOL077C SPO20Q04359 397 aa5.1□□□□□ -1.59
BRX1YOL077C AOS1Q06624 347 aa5.1□□□□□ -1.59
BRX1YOL077C NBA1Q08229 501 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
BRX1YOL077C CCZ1P38273 704 aa5.09□□□□□ -1.59
BRX1YOL077C PEX7P39108 375 aa5.09□□□□□ -1.59
BRX1YOL077C GTS1P40956 396 aa5.09□□□□□ -1.59
BRX1YOL077C KRI1P42846 591 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
BRX1YOL077C TNA1P53322 534 aa5.09□□□□□ -1.59
BRX1YOL077C NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data5.09□□□□□ -1.59not detected
BRX1YOL077C HOS3Q02959 697 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
BRX1YOL077C NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data5.09□□□□□ -1.59not detected
BRX1YOL077C PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data5.08□□□□□ -1.6 RIP-Chip
BRX1YOL077C SRO9P25567 434 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C VAC8P39968 578 aa5.08□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C RPN3P40016 523 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C FAA4P47912 694 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C CTH1P47976 325 aa5.08□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C YGR053CP53234 283 aa5.08□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C EEB1Q02891 456 aa5.08□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C FAL1Q12099 399 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C SAM35P14693 329 aa5.07□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C AIM26P32858 118 aa5.07□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C SNF7P39929 240 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C FOL2P51601 243 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C RSB1Q08417 382 aa5.07□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C YER152CP10356 443 aa5.06□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C INO1P11986 533 aa5.06□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C HSP78P33416 811 aa5.06□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C YKL107WP34251 309 aa5.06□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C MOT2P34909 587 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C MPH1P40562 993 aa5.06□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C ALD6P54115 500 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C GNT1Q12096 491 aa5.06□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C RKM4Q12504 494 aa5.06□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C BAS1P22035 811 aa5.05□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C POL12P38121 705 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C RSC58Q07979 502 aa5.05□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C SPS1P08458 490 aa5.04□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C SEA4P38164 1038 aa5.04□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C PRI2P20457 528 aa5.03□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C PIK1P39104 1066 aa5.03□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C YGL176CP46945 554 aa5.03□□□□□ -1.6
BRX1YOL077C BAP2P38084 609 aa5.02□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C OPI10Q08202 246 aa5.02□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C WRS1Q12109 432 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C DFG16Q99234 619 aa5.02□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C SNF5P18480 905 aa5.01□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C ABD1P32783 436 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data5.01□□□□□ -1.61not detected
BRX1YOL077C ECL1P48235 211 aa5.01□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C ORC3P54790 616 aa5.01□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C LPX1Q12405 387 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C AGP1P25376 633 aa5□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C SBA1P28707 216 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C MXR1P40029 184 aa5□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C ESC2Q06340 456 aa5□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C ACM1Q08981 209 aa5□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C YPL066WQ12194 479 aa5□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C UGA2P38067 497 aa4.99□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C SEC26P41810 973 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C YFL054CP43549 646 aa4.99□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C ENV11P53246 860 aa4.99□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C THS1P04801 734 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C LRG1P35688 1017 aa4.98□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C GEM1P39722 662 aa4.98□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C AVT1P47082 602 aa4.98□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C TDA5Q06417 326 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C YOR352WQ08816 343 aa4.98□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C YKL069WP36088 180 aa4.97□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C RFC5P38251 354 aa4.97□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C ETP1P38748 585 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C PNT1P38969 423 aa4.97□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C SHE9Q04172 456 aa4.97□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C SVS1Q12254 260 aa4.97□□□□□ -1.61
BRX1YOL077C DBP2P24783 546 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
BRX1YOL077C SEG2P34250 1132 aa4.96□□□□□ -1.62
BRX1YOL077C VBA5P36172 582 aa4.96□□□□□ -1.62
BRX1YOL077C PRP43P53131 767 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
BRX1YOL077C RSM24Q03976 319 aa4.96□□□□□ -1.62
BRX1YOL077C SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
BRX1YOL077C MRP8P35719 219 aa4.95□□□□□ -1.62
BRX1YOL077C MBP1P39678 833 aa4.95□□□□□ -1.62
BRX1YOL077C SPF1P39986 1215 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
BRX1YOL077C SIP5P40210 489 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
BRX1YOL077C SNO2P53823 222 aa4.95□□□□□ -1.62
BRX1YOL077C MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data4.95□□□□□ -1.62not detected
BRX1YOL077C BI4P03879 638 aa4.94□□□□□ -1.62
BRX1YOL077C KIN2P13186 1147 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
BRX1YOL077C GAS1P22146 559 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
BRX1YOL077C SLA2P33338 968 aa4.94□□□□□ -1.62
BRX1YOL077C RRT14P40470 206 aa4.94□□□□□ -1.62
BRX1YOL077C GRX1P25373 110 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
BRX1YOL077C IRR1P40541 1150 aa4.93□□□□□ -1.62
BRX1YOL077C MRPL22P53881 309 aa4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.5 ms