RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeastyeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4YOL003C PRI2P20457 528 aa6.89□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data6.89□□□□□ -1.31not detected
PFA4YOL003C SBA1P28707 216 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C MOT2P34909 587 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C YKR073CP36153 106 aa6.89□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C MCM7P38132 845 aa6.89□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C PEX7P39108 375 aa6.89□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C ESC2Q06340 456 aa6.89□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C MED7Q08278 222 aa6.89□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C ABD1P32783 436 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C BAP2P38084 609 aa6.88□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C YHL012WP38709 493 aa6.88□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C SPF1P39986 1215 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C WRS1Q12109 432 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C CYC7P00045 113 aa6.87□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C GCD1P09032 578 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C SNF5P18480 905 aa6.87□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C SRO9P25567 434 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C YKL107WP34251 309 aa6.87□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C TNA1P53322 534 aa6.87□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C HOS3Q02959 697 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C SHE9Q04172 456 aa6.87□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C TRE1Q08919 783 aa6.87□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C MDL2P33311 773 aa6.86□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C TAT2P38967 592 aa6.86□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C YGL176CP46945 554 aa6.86□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C NSI1Q12457 570 aa6.86□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data6.85□□□□□ -1.31not detected
PFA4YOL003C SIP5P40210 489 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C NNF1P47149 201 aa6.85□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C TDA5Q06417 326 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C COQ4O13525 335 aa6.84□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C VBA5P36172 582 aa6.84□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C TOS1P38288 455 aa6.84□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C PNT1P38969 423 aa6.84□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C SNF7P39929 240 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C YJL049WP47048 450 aa6.84□□□□□ -1.31
PFA4YOL003C RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C GRX1P25373 110 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C OCA5P38738 679 aa6.83□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C PIK1P39104 1066 aa6.83□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C SBP1P10080 294 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C DBP2P24783 546 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data6.82□□□□□ -1.32 RIP-Chip
PFA4YOL003C MRP8P35719 219 aa6.82□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C INP52P50942 1183 aa6.82□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C ALO1P54783 526 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C SSY1Q03770 852 aa6.82□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C PRO1P32264 428 aa6.81□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C CCZ1P38273 704 aa6.81□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C YFL054CP43549 646 aa6.81□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C CTH1P47976 325 aa6.81□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C RSC58Q07979 502 aa6.81□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C ADP1P25371 1049 aa6.8□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C STE5P32917 917 aa6.8□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C PTC7P38797 343 aa6.8□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C MXR1P40029 184 aa6.8□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C ORC3P54790 616 aa6.8□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C SDH1Q00711 640 aa6.8□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C NAN1Q02931 896 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C BRE4Q07660 1125 aa6.8□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C SLA2P33338 968 aa6.79□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C MBP1P39678 833 aa6.79□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C GEM1P39722 662 aa6.79□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C IRR1P40541 1150 aa6.79□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C GTS1P40956 396 aa6.79□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C ACM1Q08981 209 aa6.79□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C LPX1Q12405 387 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C OMA1P36163 345 aa6.78□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C PBY1P38254 753 aa6.78□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C YBR184WP38299 523 aa6.78□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C NBA1Q08229 501 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PFA4YOL003C UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data6.76□□□□□ -1.33not detected
PFA4YOL003C ATG13Q06628 738 aa6.76□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C YOL098CQ12496 1037 aa6.76□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C RAD4P14736 754 aa6.75□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C LIP5P32875 414 aa6.75□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C UGA2P38067 497 aa6.75□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C IOC3P43596 787 aa6.75□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C PFD1P46988 109 aa6.75□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C FMP25Q08023 583 aa6.75□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C THS1P04801 734 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C AIM26P32858 118 aa6.74□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data6.74□□□□□ -1.33not detected
PFA4YOL003C NSE3Q05541 303 aa6.74□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C RSB1Q08417 382 aa6.74□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C BI4P03879 638 aa6.73□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C HSP78P33416 811 aa6.73□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C YKL151CP36059 337 aa6.73□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C BDF2Q07442 638 aa6.73□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C SPS1P08458 490 aa6.72□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C RPL8BP29453 256 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C SEC26P41810 973 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C SPO75Q07798 868 aa6.72□□□□□ -1.33
PFA4YOL003C STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data6.71□□□□□ -1.34not detected
PFA4YOL003C PRP9P19736 530 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PFA4YOL003C MAC1P35192 417 aa6.71□□□□□ -1.34
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