RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	VPS30	Q02948	557 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	LCD1	Q04377	747 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	GUD1	Q07729	489 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	YLL058W	Q12198	575 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	RAD59	Q12223	238 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	RIT1	P23796	513 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	YGR035C	P53222	116 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	PNG1	Q02890	363 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	TAH18	Q12181	623 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	PRC1	P00729	532 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	NUC1	P08466	329 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	FUB1	P25659	250 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	PPZ1	P26570	692 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	SYN8	P31377	255 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	SPT23	P35210	1082 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	YGR273C	P53329	174 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	UFD2	P54860	961 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	SKY1	Q03656	742 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	SPO71	Q03868	1245 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	CAN1	P04817	590 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	POL3	P15436	1097 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	AFT1	P22149	690 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	PES4	P39684	611 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	OPT1	P40897	799 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	UBP15	P50101	1230 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	FMS1	P50264	508 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	LIF1	P53150	421 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	HAP5	Q02516	242 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	FMP27	Q06179	2628 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	SUV3	P32580	737 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	YTA12	P40341	825 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	HUL4	P40985	892 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	LSB1	P53281	241 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	CDC45	Q08032	650 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	KEX2	P13134	814 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	KIN82	P25341	720 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	ANP1	P32629	500 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	MYO3	P36006	1272 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	DRE2	P36152	348 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	SAD1	P43589	448 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	YML020W	Q03722	664 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.18	□□□□□ -1.58	not detected
YNL057W	YNL057W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	MMR1	Q06324	491 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	MBR1	P23493	339 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	MET1	P36150	593 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	BNI4	P53858	892 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	HDA1	P53973	706 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	GPI13	Q07830	1017 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	IRC10	Q08118	586 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	MPC54	Q08550	464 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	RAD2	P07276	1031 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	KTR4	P38131	464 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	APN2	P38207	520 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	SLX1	P38324	304 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	HXT5	P38695	592 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	STB5	P38699	743 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	MRPS35	P53292	345 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	YLR455W	Q06188	304 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YNL057W	YNL057W	BET2	P20133	325 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	MSS51	P32335	436 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	UGA4	P32837	571 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	DID4	P36108	232 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	HUL5	P53119	910 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	SVF1	Q05515	481 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	PIG1	Q06216	648 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	SGO1	Q08490	590 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	OPI1	P21957	404 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	ADK2	P26364	225 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	APM2	P38700	605 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	CSM2	P40465	213 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	MDM1	Q01846	1127 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.8 ms