RNA–Protein interactions for RNA: YML113W

DAT1, Transcript of DNA binding protein that recognizes oligo(dA).oligo(dT) tracts, yeast

Gene DAT1, Length 747 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DAT1	YML113W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	ROX1	P25042	368 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	GDE1	Q02979	1223 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	RTP1	Q12751	981 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	KEX1	P09620	729 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	CBP3	P21560	335 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	RDS1	P25611	832 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	RXT2	P38255	430 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	SUL1	P38359	859 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	EAR1	Q03212	550 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	OXR1	Q08952	273 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	MAS2	P11914	482 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	MAL33	P38157	468 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	HAP5	Q02516	242 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	ARP6	Q12509	438 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	AVT3	P36062	692 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	PCI8	P40512	444 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	UBP15	P50101	1230 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	GIS4	Q04233	774 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	LDB19	Q12502	818 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	HIP1	P06775	603 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	YPR117W	Q06116	2489 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DAT1	YML113W	CDC6	P09119	513 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	RGP1	P16664	663 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	RSM25	P40496	264 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	CIR1	P42940	261 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	VPS72	Q03388	795 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	MYO1	P08964	1928 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	SNA3	P14359	133 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	ORC4	P54791	529 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	MSC2	Q03455	724 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	APC11	Q12157	165 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	YLL058W	Q12198	575 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	ATG11	Q12527	1178 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	MBR1	P23493	339 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	ASF1	P32447	279 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	SAS3	P34218	831 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	DID4	P36108	232 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	YGL138C	P53122	345 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	DCS2	Q12123	353 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	CEX1	Q12453	761 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	CLC1	P17891	233 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.61	□□□□□ -0.55	not detected
DAT1	YML113W	CLB5	P30283	435 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	DUR3	P33413	735 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	UBP11	P36026	717 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	YGR273C	P53329	174 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	AHC1	Q12433	566 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	AIM44	Q99299	758 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	KIN82	P25341	720 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	ISW1	P38144	1129 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	AZR1	P50080	613 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	HUL5	P53119	910 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	TVP38	P36164	337 aa		11.59	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	MSC7	P38694	644 aa		11.59	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	FAR11	P53917	953 aa		11.59	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	TIP41	Q12199	356 aa		11.59	□□□□□ -0.55
DAT1	YML113W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
DAT1	YML113W	RPN12	P32496	274 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DAT1	YML113W	CIT3	P43635	486 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DAT1	YML113W	SGM1	P47166	707 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DAT1	YML113W	YML020W	Q03722	664 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DAT1	YML113W	AIM33	Q04516	312 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DAT1	YML113W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
DAT1	YML113W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
DAT1	YML113W	ESS1	P22696	170 aa		11.57	□□□□□ -0.56
DAT1	YML113W	ELM1	P32801	640 aa		11.57	□□□□□ -0.56
DAT1	YML113W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
DAT1	YML113W	RET3	P53600	189 aa		11.57	□□□□□ -0.56
DAT1	YML113W	YNL115C	P53925	644 aa		11.57	□□□□□ -0.56
DAT1	YML113W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
DAT1	YML113W	PHM6	Q05637	104 aa		11.57	□□□□□ -0.56
DAT1	YML113W	CRD1	Q07560	283 aa		11.57	□□□□□ -0.56
DAT1	YML113W	GPI13	Q07830	1017 aa		11.57	□□□□□ -0.56

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