RNA–Protein interactions for RNA: YLR197W

NOP56, Transcript of Essential evolutionarily-conserved nucleolar protein, yeast

Gene NOP56, Length 1,515 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NOP56	YLR197W	NSI1	Q12457	570 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	YER152C	P10356	443 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	PEX7	P39108	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	SAM35	P14693	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	SEA4	P38164	1038 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	YHL012W	P38709	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	ESC2	Q06340	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	RKM4	Q12504	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	MDL2	P33311	773 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	YKL069W	P36088	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	TOS1	P38288	455 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	YGL176C	P46945	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	TNA1	P53322	534 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	GNT1	Q12096	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NOP56	YLR197W	AGP1	P25376	633 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	BAP2	P38084	609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	SSY1	Q03770	852 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	ADP1	P25371	1049 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	PRO1	P32264	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
NOP56	YLR197W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
NOP56	YLR197W	YKL107W	P34251	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	OMA1	P36163	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	INP52	P50942	1183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	SDH1	Q00711	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	COQ4	O13525	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	SNF5	P18480	905 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	PTC7	P38797	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	GTS1	P40956	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	CTH1	P47976	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	VBA5	P36172	582 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	PNT1	P38969	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	MXR1	P40029	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	YFL054C	P43549	646 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	SHE9	Q04172	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	RSC58	Q07979	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	CCZ1	P38273	704 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	LIP5	P32875	414 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	MAC1	P35192	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	PIK1	P39104	1066 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	MBP1	P39678	833 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	NNF1	P47149	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
NOP56	YLR197W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	AIM26	P32858	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	TAT2	P38967	592 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	GEM1	P39722	662 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	ORC3	P54790	616 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	RSB1	Q08417	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	STE5	P32917	917 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	MRP8	P35719	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	YBR184W	P38299	523 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	ACM1	Q08981	209 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NOP56	YLR197W	HSP78	P33416	811 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	UGA2	P38067	497 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	IRR1	P40541	1150 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	SLA2	P33338	968 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	PBY1	P38254	753 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	YJL049W	P47048	450 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	SPS1	P08458	490 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	OCA5	P38738	679 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	RAD4	P14736	754 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	YKL151C	P36059	337 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	SPO75	Q07798	868 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	BI4	P03879	638 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	LRG1	P35688	1017 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	PFD1	P46988	109 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	ATG13	Q06628	738 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	FMP25	Q08023	583 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	SVS1	Q12254	260 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NOP56	YLR197W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.1 ms