RNA–Protein interactions for RNA: YKL099C

UTP11, Transcript of Subunit of U3-containing Small Subunit (SSU) processome complex, yeast

Gene UTP11, Length 753 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP11	YKL099C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	ADR1	P07248	1323 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	RAD53	P22216	821 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	MLF3	P32047	452 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	YBL028C	P38202	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	LYS14	P40971	790 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	NET1	P47035	1189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	ROM1	P53046	1155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	EAR1	Q03212	550 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	YDL144C	Q07589	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	PPM2	Q08282	695 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	STB3	Q12427	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	HAP4	P14064	554 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	RAD24	P32641	659 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	MSC7	P38694	644 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	UBP12	P39538	1254 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	VAB2	P40003	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	INM2	Q05533	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	TGL4	P36165	910 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	HXT5	P38695	592 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	FIR1	P40020	876 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	YJR008W	P47085	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UTP11	YKL099C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	RGP1	P16664	663 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	FPS1	P23900	669 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	PIP2	P52960	996 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	AHC1	Q12433	566 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	UIP5	P36137	443 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	YJR107W	P47145	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	RMD1	Q03441	430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	MET7	Q08645	548 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	ICL2	Q12031	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	UBR2	Q07963	1872 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	VPS13	Q07878	3144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	SUV3	P32580	737 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	SKN7	P38889	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	YFL040W	P43562	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	BOI2	P39969	1040 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	YTA6	P40328	754 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	TDA6	Q06466	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	PCL8	Q08966	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	LAP2	Q10740	671 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	KTR2	P33550	425 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	CST26	P38226	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	SKP1	P52286	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	YNL193W	P53870	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	ECM23	Q02710	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	CSI1	Q04368	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	SUT2	Q12286	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	PIF1	P07271	859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	SNF3	P10870	884 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
UTP11	YKL099C	PUP1	P25043	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	EUG1	P32474	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	SCD5	P34758	872 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	HIP1	P06775	603 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	RPC31	P17890	251 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	MTO1	P53070	669 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	YAF9	P53930	226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	FMP30	Q02883	468 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	YML037C	Q03703	340 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTP11	YKL099C	MYO1	P08964	1928 aa		4.84	□□□□□ -1.64
UTP11	YKL099C	VAN1	P23642	535 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTP11	YKL099C	PER1	P25625	357 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTP11	YKL099C	KAP122	P32767	1081 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTP11	YKL099C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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