RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	GNP1	P48813	663 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	YER152C	P10356	443 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	SNF5	P18480	905 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	MLS1	P30952	554 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	FLR1	P38124	548 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	MGE1	P38523	228 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	ROT1	Q03691	256 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	COQ4	O13525	335 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	GIP4	P39732	760 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	YJR107W	P47145	328 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	TNA1	P53322	534 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	SIW14	P53965	281 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	SNO2	P53823	222 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	RSB1	Q08417	382 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	BAP2	P38084	609 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	RIM8	P53179	542 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
YKL063C	YKL063C	PLB2	Q03674	706 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	CCZ1	P38273	704 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	SRM1	P21827	482 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	RER2	P35196	286 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	MCM7	P38132	845 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	MXR1	P40029	184 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	SPT20	P50875	604 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YKL063C	YKL063C	SOD2	P00447	233 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	CMP2	P14747	604 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	PIK1	P39104	1066 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	GAL10	P04397	699 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	TAF13	P11747	167 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
YKL063C	YKL063C	LAM1	P38851	1228 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	CNN1	P43618	361 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	SGD1	Q06132	899 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	RGD1	P38339	666 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	MEF2	P39677	819 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	MPH1	P40562	993 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	DUT1	P33317	147 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
YKL063C	YKL063C	SVS1	Q12254	260 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	BAS1	P22035	811 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	HEM3	P28789	327 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	RFC5	P38251	354 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	GCV2	P49095	1034 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	GCN5	Q03330	439 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	APL1	P27351	700 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	EEB1	Q02891	456 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	ESC2	Q06340	456 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YKL063C	YKL063C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	UGA2	P38067	497 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
YKL063C	YKL063C	RSM24	Q03976	319 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	DUS4	Q06063	367 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	BI4	P03879	638 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
YKL063C	YKL063C	RAD27	P26793	382 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	CTS1	P29029	562 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	INO1	P11986	533 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	PET112	P33893	541 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	ENT3	P47160	408 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	HNT2	P49775	206 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	XYL2	Q07993	356 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	YLR358C	O13565	187 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	CDC6	P09119	513 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	CDC34	P14682	295 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	LYP1	P32487	611 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	YGL176C	P46945	554 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	HFM1	P51979	1187 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	YAP6	Q03935	383 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	TMA10	Q06177	86 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	GNT1	Q12096	491 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	ACE2	P21192	770 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	CDC20	P26309	610 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKL063C	YKL063C	SLA2	P33338	968 aa		4.66	□□□□□ -1.66

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