RNA–Protein interactions for RNA: YJL178C

ATG27, Transcript of Type I membrane protein involved in autophagy and the Cvt pathway, yeast

Gene ATG27, Length 816 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG27	YJL178C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	MDL2	P33311	773 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	RGD1	P38339	666 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	GPB2	P39717	880 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	ECL1	P48235	211 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	RER2	P35196	286 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	IRC24	P40580	263 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	CNN1	P43618	361 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	CWC24	P53769	259 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	EEB1	Q02891	456 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	AOS1	Q06624	347 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	COQ4	O13525	335 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	CLN2	P20438	545 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	VAC8	P39968	578 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	SNF5	P18480	905 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	BAP2	P38084	609 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	HNT2	P49775	206 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	TNA1	P53322	534 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
ATG27	YJL178C	CDA2	Q06703	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	RSC58	Q07979	502 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	SPO21	Q12411	609 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	INO80	P53115	1489 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	YFL054C	P43549	646 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG27	YJL178C	YER152C	P10356	443 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	PRI2	P20457	528 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	MLS1	P30952	554 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	LYP1	P32487	611 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	AIM26	P32858	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	CCZ1	P38273	704 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	NIT1	P40447	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	MPH1	P40562	993 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	YGR053C	P53234	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	ESC2	Q06340	456 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	PIK1	P39104	1066 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	BAS1	P22035	811 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
ATG27	YJL178C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	TYW3	P53177	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	ENV11	P53246	860 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	GNT1	Q12096	491 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	YKL069W	P36088	180 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	MCM7	P38132	845 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	UBP5	P39944	805 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
ATG27	YJL178C	SPO20	Q04359	397 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	SSN2	P38931	1420 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	INO1	P11986	533 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	THI80	P35202	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	MRPL22	P53881	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	OPI10	Q08202	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	RKM4	Q12504	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	SPS1	P08458	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	RSB1	Q08417	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG27	YJL178C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	MXR1	P40029	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	YKL107W	P34251	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	YGL176C	P46945	554 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	ACM1	Q08981	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	AGP1	P25376	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
ATG27	YJL178C	PNT1	P38969	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	GEM1	P39722	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	SNO2	P53823	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG27	YJL178C	ATG13	Q06628	738 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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