RNA–Protein interactions for RNA: YHR029C

YHI9, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YHI9, Length 885 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHI9	YHR029C	CTH1	P47976	325 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	ATG13	Q06628	738 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	CIT1	P00890	479 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	FLP1	P03870	423 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	CAN1	P04817	590 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	ATP4	P05626	244 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	MSH2	P25847	964 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	YGR130C	P53278	816 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	YPL109C	Q02981	657 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	REC8	Q12188	680 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	ARE1	P25628	610 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	DUT1	P33317	147 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	BLI1	P35727	113 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	PAN5	P38787	379 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	AKR1	P39010	764 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	PMT3	P47190	753 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	TFB2	Q02939	513 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	NUP145	P49687	1317 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	FUS1	P11710	512 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
YHI9	YHR029C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	YKL222C	P35995	705 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	SAF1	P38352	637 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	YAP1801	P38856	637 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	MON1	P53129	644 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	GUP1	P53154	560 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	COB	P00163	385 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	INH1	P01097	85 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	PIF1	P07271	859 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	CHS2	P14180	963 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	STE5	P32917	917 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	TFA2	P36145	328 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	GEM1	P39722	662 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	PIC2	P40035	300 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	HUL4	P40985	892 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	LEM3	P42838	414 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	CTR9	P89105	1077 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	ULP1	Q02724	621 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	ADI1	Q03677	179 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	EAF1	Q06337	982 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	ESC2	Q06340	456 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	AOS1	Q06624	347 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	SOG2	Q08817	791 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	MPD2	Q99316	277 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	GCR1	P07261	785 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	PEX6	P33760	1030 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	IES5	P40060	125 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	NEO1	P40527	1151 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	THI73	Q07904	523 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	NPR1	P22211	790 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	NFU1	P32860	256 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	DUR3	P33413	735 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	JNM1	P36224	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	ERP6	P53198	216 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	UME1	Q03010	460 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	UGO1	Q03327	502 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
YHI9	YHR029C	FMP25	Q08023	583 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	OPI1	P21957	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	TFC3	P34111	1160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	MAL31	P38156	614 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	PEA2	P40091	420 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	RTA1	P53047	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	PEX14	P53112	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	NUT1	P53114	1132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	YNL193W	P53870	558 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	COG6	P53959	839 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	UBX4	P54730	416 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	EEB1	Q02891	456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	MSH6	Q03834	1242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	CYC7	P00045	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	SSH4	P32343	579 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	ELM1	P32801	640 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	MRP8	P35719	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YHI9	YHR029C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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