RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		12.27	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	PIK3C2A	O00443	1686 aa		12.27	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	12.26	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	ADAMTS2	O95450	1211 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	12.26	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	SIL1	Q9H173	461 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM161A	Q3B820	660 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	BRINP3	Q76B58	766 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	STK31	Q9BXU1	1019 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	G2E3	Q7L622	706 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF853	P0CG23	659 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	12.25	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	MST1R	Q04912	1400 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	PEAK1	Q9H792	1746 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	CHL1	O00533	1208 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNQ3	O43525	872 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	PPFIA3	O75145	1194 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		12.23	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	EVA1C	P58658	441 aa		12.23	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		12.23	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	LGR6	Q9HBX8	967 aa		12.23	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	12.23	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	RTL1	A6NKG5	1358 aa		12.23	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	NFKBIB	Q15653	356 aa		12.23	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		12.23	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	BACH2	Q9BYV9	841 aa		12.23	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	12.22	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	KDM4A	O75164	1064 aa		12.22	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	12.22	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	12.22	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	KDR	P35968	1356 aa		12.22	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	MAP3K5	Q99683	1374 aa		12.22	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		12.21	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	FGD1	P98174	961 aa		12.21	□□□□□ -0.45
CTCFL-222	ENST00000609232	NWD1	Q149M9	1564 aa		12.21	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		12.21	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		12.2	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		12.2	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	MEIS3	Q99687	375 aa		12.19	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	KIAA0232	Q92628	1395 aa		12.19	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		12.19	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	USP19	O94966	1318 aa		12.19	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	ERBB3	P21860	1342 aa		12.19	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	BTBD11	A6QL63	1104 aa		12.18	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		12.18	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	DCC	P43146	1447 aa		12.18	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		12.18	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM182B	Q5T319	152 aa		12.18	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	AAMP	Q13685	434 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNQ4	P56696	695 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	SPG7	Q9UQ90	795 aa		12.16	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	CRB1	P82279	1406 aa		12.16	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		12.15	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		12.15	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		12.15	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	FOSB	P53539	338 aa		12.15	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		12.15	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		12.15	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		12.15	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	NFAT5	O94916	1531 aa		12.15	□□□□□ -0.46
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNJ4	P48050	445 aa		12.15	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	LTN1	O94822	1766 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	NPHP1	O15259	732 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	KIF1A	Q12756	1690 aa		12.13	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		12.13	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47

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