RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD1Q15327 319 aa19.68■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KDM6BO15054 1643 aa19.68■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC83Q8IWF9 413 aa19.68■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANXA1P04083 346 aa19.68■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ESPNB1AK53 854 aa19.68■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPS2Q13227 327 aa19.67■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUP133Q8WUM0 1156 aa19.67■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SSFA2P28290 1259 aa19.67■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC70Q6NSX1 233 aa19.67■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AEBP1Q8IUX7 1158 aa19.67■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MBIPQ9NS73 344 aa19.67■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNNQ9UQP3 1299 aa19.67■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IDH1O75874 414 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA32Q96LK8 384 aa19.66■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IKQ13123 557 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP19.66■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 30.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.66■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FLIIQ13045 1269 aa19.66■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP10AO60312 1499 aa19.66■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLHL34Q8N239 644 aa19.65■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNH5Q8NCM2 988 aa19.65■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PHF8Q9UPP1 1060 aa19.65■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa19.64■□□□□ 0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PREX2Q70Z35 1606 aa19.64■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa19.64■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa19.64■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GDPD2Q9HCC8 539 aa19.64■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYD88Q99836 296 aa19.63■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZMYM3Q14202 1370 aa19.63■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAMK4Q16566 473 aa19.62■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAAF4Q8WXU2 420 aa19.62■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OFD1O75665 1012 aa19.62■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP2B2Q01814 1243 aa19.62■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERPINC1P01008 464 aa19.62■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM22Q8IYM9 498 aa19.62■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIBF1Q8WXW3 757 aa19.62■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NACAP1Q9BZK3 213 aa19.61■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BICDL1Q6ZP65 573 aa19.61■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCF2Q9UG63 623 aa19.61■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACEP12821 1306 aa19.61■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCC1P33527 1531 aa19.61■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JMYQ8N9B5 988 aa19.61■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUP62CLQ9H1M0 184 aa19.61■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAB11FIP3O75154 756 aa19.6■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.6■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TDO2P48775 406 aa19.59■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZRANB1Q9UGI0 708 aa19.59■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PI4KAP2A4QPH2 592 aa19.59■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa19.59■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MEIS3Q99687 375 aa19.59■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPFIA3O75145 1194 aa19.58■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BMP2KLQ5H9B9 411 aa19.58■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CARD14Q9BXL6 1004 aa19.58■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFAP74Q9C0B2 1584 aa19.58■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC69A6NI79 296 aa19.58■□□□□ 0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GUCY1B3Q02153 619 aa19.58■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBC1D32Q96NH3 1257 aa19.58■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT32Q14532 448 aa19.58■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRP2BPQ9P2M1 347 aa19.58■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RLBP1P12271 317 aa19.57■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 METTL24Q5JXM2 366 aa19.57■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC82Q8N4S0 544 aa19.57■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAI14Q9P0K7 980 aa19.57■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CTNNA3Q9UI47 895 aa19.56■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFAP45Q9UL16 551 aa19.56■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A087WZG4 1122 aa19.56■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPATQ14207 1427 aa19.56■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa19.56■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa19.56■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa19.55■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C8orf58Q8NAV2 365 aa19.55■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa19.55■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TEX35Q5T0J7 233 aa19.55■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBTB3Q9H5J0 574 aa19.55■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa19.55■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TXLNAP40222 546 aa19.55■□□□□ 0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBAC1Q9BSL1 405 aa19.55■□□□□ 0.72
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