RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
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NELFE-208ENST00000481121 ATG3Q9NT62 314 aa27.75■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.73■■■□□ 2.03
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NELFE-208ENST00000481121 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa27.72■■■□□ 2.03
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NELFE-208ENST00000481121 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.64■■■□□ 2.02
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NELFE-208ENST00000481121 SLC4A9Q96Q91 983 aa27.62■■■□□ 2.01
NELFE-208ENST00000481121 MTFR1LQ9H019 292 aa27.62■■■□□ 2.01
NELFE-208ENST00000481121 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.61■■■□□ 2.01
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NELFE-208ENST00000481121 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.46■■□□□ 1.99
NELFE-208ENST00000481121 HEG1Q9ULI3 1381 aa27.45■■□□□ 1.99
NELFE-208ENST00000481121 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 LAMB4A4D0S4 1761 aa27.45■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 RPS6KA4O75676 772 aa27.44■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 MSL1Q68DK7 614 aa27.44■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 RUNDC1Q96C34 613 aa27.44■■□□□ 1.98
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NELFE-208ENST00000481121 ARXQ96QS3 562 aa27.43■■□□□ 1.98
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NELFE-208ENST00000481121 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
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NELFE-208ENST00000481121 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.41■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 KCNQ3O43525 872 aa27.4■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
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NELFE-208ENST00000481121 CCDC184Q52MB2 194 aa27.39■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
NELFE-208ENST00000481121 STARD3NLO95772 234 aa27.37■■□□□ 1.97
NELFE-208ENST00000481121 RFC4P35249 363 aa27.37■■□□□ 1.97
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