RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, human

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
OPN3-204	ENST00000469376	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		32.03	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376	RTL1	A6NKG5	1358 aa		32.03	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376	NFAT5	O94916	1531 aa		32.02	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376	KRT24	Q2M2I5	525 aa		32.01	■■■□□ 2.72
OPN3-204	ENST00000469376	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
OPN3-204	ENST00000469376	AMPH	P49418	695 aa		32.01	■■■□□ 2.71
OPN3-204	ENST00000469376	CERK	Q8TCT0	537 aa		32	■■■□□ 2.71
OPN3-204	ENST00000469376	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		31.99	■■■□□ 2.71
OPN3-204	ENST00000469376	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	31.99	■■■□□ 2.71
OPN3-204	ENST00000469376	FLT4	P35916	1363 aa		31.99	■■■□□ 2.71
OPN3-204	ENST00000469376	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
OPN3-204	ENST00000469376	RABEP1	Q15276	862 aa		31.99	■■■□□ 2.71
OPN3-204	ENST00000469376	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
OPN3-204	ENST00000469376	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
OPN3-204	ENST00000469376	PIP4K2B	P78356	416 aa		31.98	■■■□□ 2.71
OPN3-204	ENST00000469376	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
OPN3-204	ENST00000469376	KDR	P35968	1356 aa		31.97	■■■□□ 2.71
OPN3-204	ENST00000469376	MRE11	P49959	708 aa		31.96	■■■□□ 2.71
OPN3-204	ENST00000469376	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
OPN3-204	ENST00000469376	HMMR	O75330	724 aa		31.95	■■■□□ 2.71
OPN3-204	ENST00000469376	CASC1	Q6TDU7	716 aa		31.95	■■■□□ 2.71
OPN3-204	ENST00000469376	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
OPN3-204	ENST00000469376	SLC4A2	P04920	1241 aa		31.94	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	HOXC9	P31274	260 aa		31.94	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		31.94	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	MEIS3	Q99687	375 aa		31.94	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		31.93	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	LTN1	O94822	1766 aa		31.92	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		31.92	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		31.92	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	USP26	Q9BXU7	913 aa		31.92	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		31.91	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		31.91	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	IP6K1	Q92551	441 aa		31.9	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		31.9	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
OPN3-204	ENST00000469376	LRRC37A3	O60309	1634 aa		31.89	■■■□□ 2.69
OPN3-204	ENST00000469376	SDS	P20132	328 aa		31.88	■■■□□ 2.69
OPN3-204	ENST00000469376	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
OPN3-204	ENST00000469376	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		31.88	■■■□□ 2.69
OPN3-204	ENST00000469376	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
OPN3-204	ENST00000469376	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		31.86	■■■□□ 2.69
OPN3-204	ENST00000469376	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		31.85	■■■□□ 2.69
OPN3-204	ENST00000469376	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		31.84	■■■□□ 2.69
OPN3-204	ENST00000469376	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		31.84	■■■□□ 2.69
OPN3-204	ENST00000469376	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
OPN3-204	ENST00000469376	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
OPN3-204	ENST00000469376	REC8	O95072	547 aa		31.83	■■■□□ 2.69
OPN3-204	ENST00000469376	PHLPP1	O60346	1717 aa		31.83	■■■□□ 2.69
OPN3-204	ENST00000469376	ARX	Q96QS3	562 aa		31.83	■■■□□ 2.69
OPN3-204	ENST00000469376	EYA1	Q99502	592 aa		31.83	■■■□□ 2.69
OPN3-204	ENST00000469376	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
OPN3-204	ENST00000469376	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		31.83	■■■□□ 2.69
OPN3-204	ENST00000469376	STK31	Q9BXU1	1019 aa		31.82	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	G2E3	Q7L622	706 aa		31.81	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	GNAI2	P04899	355 aa		31.8	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	SSFA2	P28290	1259 aa		31.8	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	PANK2	Q9BZ23	570 aa		31.8	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	NUCB2	P80303	420 aa		31.79	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	CPD	O75976	1380 aa		31.79	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		31.79	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	ERC2	O15083	957 aa		31.77	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	ST18	O60284	1047 aa		31.77	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		31.77	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		31.77	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	APBB1	O00213	710 aa		31.77	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		31.77	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376		F6X3S4	739 aa		31.76	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	GNAI3	P08754	354 aa		31.76	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	PDE1A	P54750	535 aa		31.76	■■■□□ 2.68
OPN3-204	ENST00000469376	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
OPN3-204	ENST00000469376	ABCA3	Q99758	1704 aa		31.76	■■■□□ 2.67
OPN3-204	ENST00000469376	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		31.74	■■■□□ 2.67
OPN3-204	ENST00000469376	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
OPN3-204	ENST00000469376	CHRNA2	Q15822	529 aa		31.74	■■■□□ 2.67
OPN3-204	ENST00000469376	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		31.73	■■■□□ 2.67
OPN3-204	ENST00000469376	CACNA1F	O60840	1977 aa		31.73	■■■□□ 2.67
OPN3-204	ENST00000469376	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
OPN3-204	ENST00000469376	FLII	Q13045	1269 aa		31.72	■■■□□ 2.67
OPN3-204	ENST00000469376	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
OPN3-204	ENST00000469376	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
OPN3-204	ENST00000469376	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		31.72	■■■□□ 2.67
OPN3-204	ENST00000469376	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		31.72	■■■□□ 2.67
OPN3-204	ENST00000469376	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		31.71	■■■□□ 2.67
OPN3-204	ENST00000469376	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		31.71	■■■□□ 2.67
OPN3-204	ENST00000469376	COL18A1	P39060	1754 aa		31.7	■■■□□ 2.67
OPN3-204	ENST00000469376	MAP3K5	Q99683	1374 aa		31.7	■■■□□ 2.67
OPN3-204	ENST00000469376	ABCC6	O95255	1503 aa		31.7	■■■□□ 2.67

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