RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 MX1P20591 662 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-202ENST00000440289 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-202ENST00000440289 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ACEP12821 1306 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-202ENST00000440289 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-202ENST00000440289 FIBPO43427 364 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 CHL1O00533 1208 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 TSC1Q92574 1164 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 UQCRHP07919 91 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SPG7Q9UQ90 795 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 IL25Q9H293 177 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 MED14O60244 1454 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 FLIIQ13045 1269 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 CPS1P31327 1500 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 LTKP29376 864 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 USP25Q9UHP3 1055 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF445P59923 1031 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-202ENST00000440289 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 NLRP6P59044 892 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 ATP10DQ9P241 1426 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 TSPY26PQ9H489 355 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 KCNJ4P48050 445 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 TPM2P07951 284 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 CHMLP26374 656 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 USP48Q86UV5 1035 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 PIK3R4Q99570 1358 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 OFD1O75665 1012 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 PTPRCP08575 1304 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 SRGAP3O43295 1099 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 SPC24Q8NBT2 197 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 EYA1Q99502 592 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 USP32Q8NFA0 1604 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 FERMT3Q86UX7 667 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-202ENST00000440289 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 GNAI3P08754 354 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 MBD3O95983 291 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 TNRQ92752 1358 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 FOSBP53539 338 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 NECAB1Q8N987 351 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 PPFIA3O75145 1194 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 BRD1O95696 1058 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 CAMK4Q16566 473 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 AGLP35573 1532 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 RASEFQ8IZ41 740 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 SIL1Q9H173 461 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 RGS12O14924 1447 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 STK3Q13188 491 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRJ-202ENST00000440289 AK2P54819 239 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRJ-202ENST00000440289 ATP8B2P98198 1209 aa22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms