RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CCL20-201ENST00000358813 CYLDQ9NQC7 956 aa8.65□□□□□ -1.02
CCL20-201ENST00000358813 UPP2O95045 317 aa8.64□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 MEIOBQ8N635 442 aa8.64□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 PBRM1Q86U86 1689 aa8.64□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 SCARF1Q14162 830 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 Q6ZVU0 165 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 LILRA1O75019 489 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 BMP2P12643 396 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 ERCC3P19447 782 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 ZNF787Q6DD87 383 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 SENP2Q9HC62 589 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 CUX1P39880 1505 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 GRIN2AQ12879 1464 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 PIK3CDO00329 1044 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 SKIP12755 728 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 SCTRP47872 440 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 ERVK-9P63128 1117 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 RELBQ01201 579 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 ZFP42Q96MM3 310 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 POTECB2RU33 542 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 ADH1AP07327 375 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 KIFC2Q96AC6 838 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 USP4Q13107 963 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 CEP170Q5SW79 1584 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 SIRT1Q96EB6 747 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 TRIM47Q96LD4 638 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 PTGIRP43119 386 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 KDM6BO15054 1643 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 USP17L3A6NCW0 530 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 USP17L4A6NCW7 530 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 EML3Q32P44 896 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 STK32AQ8WU08 396 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 ADAMTS12P58397 1594 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 UNCXA6NJT0 531 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 FAM196BA6NMK8 535 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 USP17L5A8MUK1 530 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 SPINT1O43278 529 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 USP35Q9P2H5 1018 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 ERCC6L2Q5T890 1561 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 SSFA2P28290 1259 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 NCOA4Q13772 614 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 NUP160Q12769 1436 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 TTLL8A6PVC2 850 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-201ENST00000358813 MEN1O00255 615 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-201ENST00000358813 MAN1A2O60476 641 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-201ENST00000358813 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-201ENST00000358813 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-201ENST00000358813 NOD1Q9Y239 953 aa8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.2 ms