RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CCL20-201ENST00000358813 CYLDQ9NQC7 956 aa8.65□□□□□ -1.02
CCL20-201ENST00000358813 UPP2O95045 317 aa8.64□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 MEIOBQ8N635 442 aa8.64□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 PBRM1Q86U86 1689 aa8.64□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 SCARF1Q14162 830 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 Q6ZVU0 165 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 LILRA1O75019 489 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 BMP2P12643 396 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 ERCC3P19447 782 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 ZNF787Q6DD87 383 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 SENP2Q9HC62 589 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 CUX1P39880 1505 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 GRIN2AQ12879 1464 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 PIK3CDO00329 1044 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 SKIP12755 728 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 SCTRP47872 440 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 ERVK-9P63128 1117 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 RELBQ01201 579 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 ZFP42Q96MM3 310 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 POTECB2RU33 542 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 ADH1AP07327 375 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 KIFC2Q96AC6 838 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-201ENST00000358813 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 USP4Q13107 963 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 CEP170Q5SW79 1584 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 SIRT1Q96EB6 747 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 TRIM47Q96LD4 638 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 PTGIRP43119 386 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 KDM6BO15054 1643 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 USP17L3A6NCW0 530 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 USP17L4A6NCW7 530 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 EML3Q32P44 896 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 STK32AQ8WU08 396 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 ADAMTS12P58397 1594 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 UNCXA6NJT0 531 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 FAM196BA6NMK8 535 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 USP17L5A8MUK1 530 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 SPINT1O43278 529 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 USP35Q9P2H5 1018 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 ERCC6L2Q5T890 1561 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 SSFA2P28290 1259 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 NCOA4Q13772 614 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 NUP160Q12769 1436 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCL20-201ENST00000358813 TTLL8A6PVC2 850 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-201ENST00000358813 MEN1O00255 615 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-201ENST00000358813 MAN1A2O60476 641 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-201ENST00000358813 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-201ENST00000358813 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-201ENST00000358813 NOD1Q9Y239 953 aa8.52□□□□□ -1.05
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