RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341735.3

MESP2-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP2, Length 1,552 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP2-201ENST00000341735 BTAF1O14981 1849 aa29■■■□□ 2.23
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MESP2-201ENST00000341735 WWC1Q8IX03 1113 aa28.96■■■□□ 2.23
MESP2-201ENST00000341735 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
MESP2-201ENST00000341735 APBA3O96018 575 aa28.95■■■□□ 2.22
MESP2-201ENST00000341735 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.95■■■□□ 2.22
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MESP2-201ENST00000341735 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.92■■■□□ 2.22
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MESP2-201ENST00000341735 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.92■■■□□ 2.22
MESP2-201ENST00000341735 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
MESP2-201ENST00000341735 SLC39A6Q13433 755 aa28.89■■■□□ 2.22
MESP2-201ENST00000341735 MIS18AQ9NYP9 233 aa28.88■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 PLSCR1O15162 318 aa28.88■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 WDR63Q8IWG1 891 aa28.88■■■□□ 2.21
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MESP2-201ENST00000341735 ZNF790Q6PG37 636 aa28.86■■■□□ 2.21
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MESP2-201ENST00000341735 CFAP44Q96MT7 982 aa28.86■■■□□ 2.21
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MESP2-201ENST00000341735 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.84■■■□□ 2.21
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MESP2-201ENST00000341735 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.83■■■□□ 2.21
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MESP2-201ENST00000341735 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.79■■■□□ 2.2
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MESP2-201ENST00000341735 USP16Q9Y5T5 823 aa28.62■■■□□ 2.17
MESP2-201ENST00000341735 STARD3NLO95772 234 aa28.62■■■□□ 2.17
MESP2-201ENST00000341735 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
MESP2-201ENST00000341735 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.62■■■□□ 2.17
MESP2-201ENST00000341735 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.61■■■□□ 2.17
MESP2-201ENST00000341735 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
MESP2-201ENST00000341735 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
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