RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
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USP43-201ENST00000285199 HSP90B2PQ58FF3 399 aa18.52■□□□□ 0.56
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USP43-201ENST00000285199 AK2P54819 239 aa18.52■□□□□ 0.56
USP43-201ENST00000285199 CFAP100Q494V2 611 aa18.52■□□□□ 0.56
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USP43-201ENST00000285199 IL16Q14005 1332 aa18.51■□□□□ 0.55
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USP43-201ENST00000285199 NLRP2Q9NX02 1062 aa18.51■□□□□ 0.55
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USP43-201ENST00000285199 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
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USP43-201ENST00000285199 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
USP43-201ENST00000285199 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
USP43-201ENST00000285199 PI4KAP2A4QPH2 592 aa18.49■□□□□ 0.55
USP43-201ENST00000285199 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa18.49■□□□□ 0.55
USP43-201ENST00000285199 HS1BP3Q53T59 392 aa18.49■□□□□ 0.55
USP43-201ENST00000285199 CFAP45Q9UL16 551 aa18.49■□□□□ 0.55
USP43-201ENST00000285199 PALD1Q9ULE6 856 aa18.49■□□□□ 0.55
USP43-201ENST00000285199 CEP135Q66GS9 1140 aa18.49■□□□□ 0.55
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