RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000135241.7

Vamp4-204, Transcript of Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vamp4, Length 1,461 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Gm13023A2A8N2 498 aa26.89■■□□□ 1.9
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Col1a2Q01149 1372 aa26.88■■□□□ 1.89
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Atxn3Q9CVD2 355 aa26.87■■□□□ 1.89
Vamp4-204ENSMUST00000135241 C4bP01029 1738 aa26.87■■□□□ 1.89
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Pde4dQ01063 747 aa26.87■■□□□ 1.89
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Klhdc4Q921I2 584 aa26.87■■□□□ 1.89
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Ralbp1Q62172 648 aa26.86■■□□□ 1.89
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Mylk2Q8VCR8 613 aa26.86■■□□□ 1.89
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Smarcc1P97496 1104 aa26.85■■□□□ 1.89
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Iqsec3Q3TES0 1195 aa26.85■■□□□ 1.89
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Miga2Q8BK03 593 aa26.85■■□□□ 1.89
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa26.84■■□□□ 1.89
Vamp4-204ENSMUST00000135241 MeiocA2AG06 965 aa26.83■■□□□ 1.89
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Gnai1B2RSH2 354 aa26.83■■□□□ 1.89
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa26.83■■□□□ 1.89
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Gnai3Q9DC51 354 aa26.83■■□□□ 1.89
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa26.81■■□□□ 1.88
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Spata31d1bE9QA57 1361 aa26.81■■□□□ 1.88
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Syde2E9PUP1 1314 aa26.81■■□□□ 1.88
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Dlg5E9Q9R9 1921 aa26.81■■□□□ 1.88
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Ubr3Q5U430 1889 aa26.8■■□□□ 1.88
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Cers3Q1A3B0 383 aa26.8■■□□□ 1.88
Vamp4-204ENSMUST00000135241 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa26.8■■□□□ 1.88
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Ankrd50F7BE84 1390 aa26.79■■□□□ 1.88
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa26.78■■□□□ 1.88
Vamp4-204ENSMUST00000135241 AtrnQ9WU60 1428 aa26.78■■□□□ 1.88
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Neurod2Q62414 383 aa26.78■■□□□ 1.88
Vamp4-204ENSMUST00000135241 TefQ9JLC6 301 aa26.78■■□□□ 1.88
Vamp4-204ENSMUST00000135241 MetP16056 1379 aa26.77■■□□□ 1.88
Vamp4-204ENSMUST00000135241 NppbP40753 121 aa26.77■■□□□ 1.88
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Zfyve9A2A8R0 1397 aa26.76■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Col4a1P02463 1669 aa26.75■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Cnnm1Q0GA42 951 aa26.75■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Clcn1Q64347 994 aa26.75■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Flad1Q8R123 492 aa26.75■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Taf7Q9R1C0 341 aa26.75■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Pibf1E9Q6K3 756 aa26.74■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Atf5O70191 283 aa26.74■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 GckrQ91X44 587 aa26.74■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Anks4bQ8K3X6 423 aa26.74■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Irx6Q9ER75 438 aa26.74■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Gm12185Q5NCB2 835 aa26.73■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 ErfeQ6PGN1 340 aa26.73■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Usp16Q99LG0 825 aa26.73■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Trpc5Q9QX29 975 aa26.73■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Jdp2P97875 163 aa26.72■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Chpf2Q3UU43 768 aa26.72■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Lrrc43Q3V0L5 667 aa26.72■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Prkab2Q6PAM0 271 aa26.72■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Tmem119Q8R138 280 aa26.71■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Zbtb1Q91VL9 713 aa26.71■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Gpr150Q8BL07 427 aa26.7■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Ccdc30Q8BVF4 654 aa26.7■■□□□ 1.87
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Col11a2Q64739 1736 aa26.69■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Sumf1Q8R0F3 372 aa26.69■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Sned1Q70E20 1403 aa26.69■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa26.68■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Tnnt1O88346 262 aa26.68■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 BcorQ8CGN4 1759 aa26.67■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 PsdQ5DTT2 1024 aa26.67■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Slfnl1Q8BHW9 410 aa26.67■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Fkbp4P30416 458 aa26.66■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Emilin1Q99K41 1017 aa26.66■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Erbb4Q61527 1308 aa26.65■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Bcl2l13P59017 434 aa26.65■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Q3TQI7 289 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Gas2l2Q5SSG4 860 aa26.64■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 PsapQ61207 557 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 IncenpQ9WU62 880 aa26.64■■□□□ 1.86
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Plch1Q4KWH5 1682 aa26.64■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 SympkQ80X82 1284 aa26.63■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Ddx60E9PZQ1 1711 aa26.63■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 CastP51125 788 aa26.62■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Morc2aQ69ZX6 1030 aa26.62■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Slc39a6Q8C145 765 aa26.62■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Col23a1Q8K4G2 532 aa26.62■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Dpf1Q9QX66 387 aa26.62■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 NudcO35685 332 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Ksr2Q3UVC0 959 aa26.62■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Prr29B1ARI9 187 aa26.61■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Prom2Q3UUY6 835 aa26.61■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Amhr2Q8K592 568 aa26.61■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Msl1Q6PDM1 616 aa26.6■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Trim52Q8CDV4 233 aa26.6■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Prr5lA2AVJ5 370 aa26.59■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Plekhh1Q80TI1 1356 aa26.59■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 En2P09066 324 aa26.58■■□□□ 1.85
Vamp4-204ENSMUST00000135241 Atp1b3P97370 278 aa26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.9 ms