RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063116.9

Msx1-201, Transcript of Homeobox protein MSX-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msx1, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hs1bp3Q3TC93 395 aa24.75■■□□□ 1.55
Msx1-201ENSMUST00000063116 CoilQ5SU73 570 aa24.75■■□□□ 1.55
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fkbp4P30416 458 aa24.74■■□□□ 1.55
Msx1-201ENSMUST00000063116 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
Msx1-201ENSMUST00000063116 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tom1O88746 492 aa24.74■■□□□ 1.55
Msx1-201ENSMUST00000063116 GckrQ91X44 587 aa24.73■■□□□ 1.55
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tmem119Q8R138 280 aa24.72■■□□□ 1.55
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atl3Q91YH5 541 aa24.72■■□□□ 1.55
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa24.71■■□□□ 1.55
Msx1-201ENSMUST00000063116 Egfem1Q8C088 590 aa24.71■■□□□ 1.55
Msx1-201ENSMUST00000063116 PappaQ8R4K8 1624 aa24.7■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa24.69■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm7361D3Z6R1 267 aa24.69■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa24.69■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm1979E9QAN3 267 aa24.69■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm5862K7N5V5 267 aa24.69■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm10220K7N660 267 aa24.69■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slc5a1Q8C3K6 665 aa24.69■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kat6bQ8BRB7 1872 aa24.69■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Bcl2l13P59017 434 aa24.69■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tm6sf1P58749 370 aa24.68■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Taf7Q9R1C0 341 aa24.68■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Iqsec3Q3TES0 1195 aa24.67■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ints5Q8CHT3 1018 aa24.67■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Prkar2bP31324 416 aa24.67■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 PsapQ61207 557 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Shank3Q4ACU6 1730 aa24.66■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pnmal2G3X9N3 661 aa24.66■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trim27Q62158 513 aa24.65■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa24.65■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Triml2E9PW10 424 aa24.65■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 SympkQ80X82 1284 aa24.65■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Echdc1Q9D9V3 322 aa24.65■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fer1l6E0CZ42 1862 aa24.65■■□□□ 1.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 PigbQ9JJQ0 542 aa24.64■■□□□ 1.53
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mast2Q60592 1734 aa24.63■■□□□ 1.53
Msx1-201ENSMUST00000063116 Adcy9P51830 1353 aa24.63■■□□□ 1.53
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zeb2Q9R0G7 1215 aa24.63■■□□□ 1.53
Msx1-201ENSMUST00000063116 Flt4P35917 1363 aa24.63■■□□□ 1.53
Msx1-201ENSMUST00000063116 SkilQ60665 675 aa24.63■■□□□ 1.53
Msx1-201ENSMUST00000063116 Igfbp6P47880 238 aa24.61■■□□□ 1.53
Msx1-201ENSMUST00000063116 Wwc1Q5SXA9 1104 aa24.61■■□□□ 1.53
Msx1-201ENSMUST00000063116 Efcab2Q9CQ46 164 aa24.61■■□□□ 1.53
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kcnh4A2A5F7 1018 aa24.6■■□□□ 1.53
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa24.59■■□□□ 1.53
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fam13aQ8BGI4 693 aa24.59■■□□□ 1.53
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fgd1P52734 960 aa24.59■■□□□ 1.53
Msx1-201ENSMUST00000063116 Prkab2Q6PAM0 271 aa24.59■■□□□ 1.53
Msx1-201ENSMUST00000063116 Col4a1P02463 1669 aa24.58■■□□□ 1.53
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cnnm1Q0GA42 951 aa24.58■■□□□ 1.53
Msx1-201ENSMUST00000063116 TefQ9JLC6 301 aa24.58■■□□□ 1.53
Msx1-201ENSMUST00000063116 AceP09470 1312 aa24.58■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Bend3Q6PAL0 825 aa24.57■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Crb1Q8VHS2 1405 aa24.57■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 LifrP42703 1092 aa24.56■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc129Q14B48 1034 aa24.55■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Stk36Q69ZM6 1316 aa24.55■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Exoc6bA6H5Z3 810 aa24.55■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atg3Q9CPX6 314 aa24.55■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Irf9Q61179 399 aa24.54■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Shank2Q80Z38 1476 aa24.54■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zap70P43404 618 aa24.53■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa24.53■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sik1Q60670 779 aa24.53■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa24.53■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa24.53■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Map3k2Q61083 619 aa24.53■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Morc2aQ69ZX6 1030 aa24.52■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cacna1sQ02789 1880 aa24.52■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nwd2Q6P5U7 1742 aa24.52■■□□□ 1.52
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slc39a6Q8C145 765 aa24.51■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ddx60E9PZQ1 1711 aa24.51■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ipo9Q91YE6 1041 aa24.51■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Psrc1Q9D0P7 329 aa24.51■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ttll7A4Q9F0 912 aa24.5■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kif18aQ91WD7 886 aa24.5■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mst1rQ62190 1378 aa24.5■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 FanclQ9CR14 375 aa24.49■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc183A2AJB1 534 aa24.49■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lrp6O88572 1613 aa24.48■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trim30dE9PWL0 497 aa24.47■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atp8b2P98199 1209 aa24.47■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Aldh8a1Q8BH00 487 aa24.47■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa24.47■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ginm1Q91WR6 327 aa24.47■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 HellsQ60848 821 aa24.47■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ppm1mQ8BU27 406 aa24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 87.1 ms