Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
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CLDN9O95484 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CLDN9O95484 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
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CLDN9O95484 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
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CLDN9O95484 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
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CLDN9O95484 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
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CLDN9O95484 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
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CLDN9O95484 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
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CLDN9O95484 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CLDN9O95484 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLDN9O95484 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLDN9O95484 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLDN9O95484 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLDN9O95484 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLDN9O95484 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLDN9O95484 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLDN9O95484 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLDN9O95484 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CLDN9O95484 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLDN9O95484 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLDN9O95484 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CLDN9O95484 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
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