Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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RABGEF1Q9UJ41 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RABGEF1Q9UJ41 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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RABGEF1Q9UJ41 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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RABGEF1Q9UJ41 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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RABGEF1Q9UJ41 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RABGEF1Q9UJ41 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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RABGEF1Q9UJ41 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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RABGEF1Q9UJ41 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RABGEF1Q9UJ41 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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RABGEF1Q9UJ41 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RABGEF1Q9UJ41 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RABGEF1Q9UJ41 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RABGEF1Q9UJ41 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RABGEF1Q9UJ41 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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RABGEF1Q9UJ41 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RABGEF1Q9UJ41 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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