Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-3□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.01□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
HMGN3Q15651 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-3.05□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-3.07□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-3.08□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
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