Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.4 ms