Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TK1P04183 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TK1P04183 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TK1P04183 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TK1P04183 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TK1P04183 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TK1P04183 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TK1P04183 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TK1P04183 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TK1P04183 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TK1P04183 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TK1P04183 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TK1P04183 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TK1P04183 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TK1P04183 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TK1P04183 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TK1P04183 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TK1P04183 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TK1P04183 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TK1P04183 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TK1P04183 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TK1P04183 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TK1P04183 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TK1P04183 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TK1P04183 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TK1P04183 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TK1P04183 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TK1P04183 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TK1P04183 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TK1P04183 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TK1P04183 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TK1P04183 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TK1P04183 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TK1P04183 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TK1P04183 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TK1P04183 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms