Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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TRAF1Q13077 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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TRAF1Q13077 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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TRAF1Q13077 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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TRAF1Q13077 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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TRAF1Q13077 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
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TRAF1Q13077 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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TRAF1Q13077 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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TRAF1Q13077 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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TRAF1Q13077 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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