Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
DDX39BQ13838 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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