Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.2 ms