Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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